RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 CLEC12BQ2HXU8 276 aa4.35□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 HLA-DRB5Q30154 266 aa4.35□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM69Q5SWH9 247 aa4.35□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.35□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 UBAP1Q9NZ09 502 aa4.35□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 BTAF1O14981 1849 aa4.35□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 SBF1O95248 1867 aa4.35□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 FSTL3O95633 263 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 TRGV3P03979 118 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 GABRA1P14867 456 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 ADORA1P30542 326 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 TGFBR2P37173 567 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 CENPWQ5EE01 88 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM156Q8N614 296 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 OR5D18Q8NGL1 313 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 OR4C13Q8NGP0 309 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM208Q9BTX3 173 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF586Q9NXT0 402 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 PRO0461Q9UI25 63 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 RTL1A6NKG5 1358 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 KIF24Q5T7B8 1368 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 SCN4AP35499 1836 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1B-205ENST00000514178 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 METTL15A6NJ78 407 aa4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 LEUTXA8MZ59 168 aa4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 E2F6O75461 281 aa4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 PSMG1O95456 288 aa4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 CGB3P0DN86 165 aa4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 CGB7P0DN87 165 aa4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 UGT2B7P16662 529 aa4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC26Q2I0M4 334 aa4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 DEFB115Q30KQ5 88 aa4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 DNM1P34Q6PK57 102 aa4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 SPNS3Q6ZMD2 512 aa4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 VN1R4Q7Z5H5 301 aa4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 TSSK6Q9BXA6 273 aa4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 MUC3AQ02505 3323 aa4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 F5H768 121 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 IGHG2P01859 326 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 PSKH1P11801 424 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 INPP1P49441 399 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNRF2Q8NHG8 242 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 TAMM41Q96BW9 452 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 PPCDCQ96CD2 204 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 POTEKPQ9BYX7 375 aa4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 CLUHO75153 1309 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 BIRC5O15392 142 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 PFN1P07737 140 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 COX5BP10606 129 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 CELP19835 753 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 MAGEA2P43356 314 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 SMAGPQ0VAQ4 97 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 CASP8Q14790 479 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC36A2Q495M3 483 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 TCF23Q7RTU1 214 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 OR9I1Q8NGQ6 314 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 SMIM19Q96E16 107 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 ICOSQ9Y6W8 199 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 LY75O60449 1722 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 USP54Q70EL1 1684 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 CEP290O15078 2479 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 NFAT5O94916 1531 aa4.31□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 CD163L1Q9NR16 1453 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 TIAM2Q8IVF5 1701 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 OR6C70A6NIJ9 312 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 A8MWP4 228 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 ZW10O43264 779 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 DEXIO95424 95 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 IGKV1D-33P01593 117 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 IGKV1-33P01594 117 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 AGTR1P30556 359 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 EVI2BP34910 448 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 SULT1A2P50226 295 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 C1DQ13901 141 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 MMDQ15546 238 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 HES3Q5TGS1 186 aa4.3□□□□□ -1.72
PGGT1B-205ENST00000514178 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms