RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503501.1

SENP6-212, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 2,041 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-212ENST00000503501 C8orf44Q96CB5 159 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 RCN3Q96D15 328 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 GLT1D1Q96MS3 346 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 METTL26Q96S19 204 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 LINC01587Q99440 93 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 CST9LQ9H4G1 147 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 LRRC40Q9H9A6 602 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 CD209Q9NNX6 404 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 HPF1Q9NWY4 346 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 HYPKQ9NX55 129 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa-0.49□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 GOLGA3Q08378 1498 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 SETD5Q9C0A6 1442 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 TONSLQ96HA7 1378 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 A0A087WX48 190 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 C9J4A7 227 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 M0R2T5 61 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 CXCL11O14625 94 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 CA2P00918 260 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 AGTP01019 485 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 MT1AP04731 61 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 MYL2P10916 166 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 PRKACAP17612 351 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 RRM2P31350 389 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 ATP6V1E1P36543 226 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 XCL1P47992 114 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 OR4D2P58180 307 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 MLF1P58340 268 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 ACTR1AP61163 376 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 PAFAH1B2P68402 229 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 TAL2Q16559 108 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 PLPPR5Q32ZL2 321 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 CEACAM21Q3KPI0 293 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 ALKBH6Q3KRA9 238 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 UBE2NLQ5JXB2 153 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 AADACL4Q5VUY2 407 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 FAM122BQ7Z309 247 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 LYG2Q86SG7 212 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 SCD5Q86SK9 330 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 LHFPL1Q86WI0 220 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 OR10Z1Q8NGY1 313 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 OR5J2Q8NH18 312 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 SGMS2Q8NHU3 365 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 ITFG1Q8TB96 612 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 ASB13Q8WXK3 278 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 RILPQ96NA2 401 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 CDCA4Q9BXL8 241 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 SNX6Q9UNH7 406 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 AP3M1Q9Y2T2 418 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 ADAMTS12P58397 1594 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 MRC2Q9UBG0 1479 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 KANK1Q14678 1352 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 PGPA6NDG6 321 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 OR2AG2A6NM03 316 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 M0QXV9 152 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 M0R2N4 97 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 ALOX12BO75342 701 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 CCNB2O95067 398 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 RLN2P04090 185 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 IFNW1P05000 195 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 SERPINA7P05543 415 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 SCGB1C2P0DMR2 95 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 SLC2A3P11169 496 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 RALBP11234 206 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 SLC25A16P16260 332 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 TNNI1P19237 187 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 CRHBPP24387 322 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 STOMP27105 288 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 BPIFB3P59826 476 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 C2orf80Q0P641 193 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 C5orf64Q2M2E5 130 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 PRAMEF20Q5VT98 475 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 TMEM220Q6QAJ8 160 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 CLEC20AQ6ZU45 233 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 CCDC121Q6ZUS5 278 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 RUFY3Q7L099 469 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 SLC35E3Q7Z769 313 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 APRG1Q8IVJ8 170 aa-0.5□□□□□ -2.49
SENP6-212ENST00000503501 GAPTQ8N292 157 aa-0.5□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms