RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 AQP3Q92482 292 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 HIST1H2BAQ96A08 127 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 C11orf52Q96A22 123 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM106AQ96A25 262 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 PTX4Q96A99 478 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 MRGPRFQ96AM1 343 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 SMIM8Q96KF7 97 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR8B4Q96RC9 309 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 AMELYQ99218 206 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 KLHDC3Q9BQ90 382 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM173AQ9BQD7 235 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 NRIP2Q9BQI9 281 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 NMES1Q9C002 83 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 SELENOIQ9C0D9 397 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 CST11Q9H112 138 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 TUBA4BQ9H853 241 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 MOB1AQ9H8S9 216 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 TREM1Q9NP99 234 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 SMCO4Q9NRQ5 59 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 SHPKQ9UHJ6 478 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 KLK13Q9UKR3 277 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 BDP1A6H8Y1 2624 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF318Q5VUA4 2279 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 GON4LQ3T8J9 2241 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 NUP210LQ5VU65 1888 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 UNC13CQ8NB66 2214 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A1W2PPE3 182 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 C1orf196B1AJZ1 125 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 FTCDNL1E5RQL4 147 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 H3BSH0 61 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 MFNGO00587 321 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 TNFSF11O14788 317 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 MPZL1O95297 269 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 CYB5AP00167 134 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 F10P00742 488 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 MT-ND4LP03901 98 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 S100A9P06702 114 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 S100A6P06703 90 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 PGAM2P15259 253 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF44P15621 663 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 CTLA4P16410 223 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF17P17021 662 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 CD82P27701 267 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 HTR2CP28335 458 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 PTGDSP41222 190 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 HAAOP46952 286 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 CSNK1A1P48729 337 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 CX3CR1P49238 355 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 CLDN6P56747 220 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 DSCR10P59022 87 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 ARG2P78540 354 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 SRYQ05066 204 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 FMODQ06828 376 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 SMCO1Q147U7 214 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 TEX30Q5JUR7 227 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 MUC21Q5SSG8 566 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 OTPQ5XKR4 325 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPINK14Q6IE38 97 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRSS54Q6PEW0 395 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 DEGS2Q6QHC5 323 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 AAED1Q7RTV5 226 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 ANGPTL5Q86XS5 388 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 BATF2Q8N1L9 274 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 GPR137CQ8N3F9 429 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF283Q8N7M2 679 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 FADS6Q8N9I5 356 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 DEFB124Q8NES8 71 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 NOXO1Q8NFA2 376 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR51A4Q8NGJ6 313 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR6X1Q8NH79 312 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 LYPD6BQ8NI32 183 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 C11orf40Q8WZ69 217 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 RAB39BQ96DA2 213 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLAMF6Q96DU3 332 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 MALSU1Q96EH3 234 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 CLCC1Q96S66 551 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 PHB2Q99623 299 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRRT1Q99946 306 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 PYGO2Q9BRQ0 406 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 DCTN5Q9BTE1 182 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-209ENST00000498399 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.5 ms