RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 ARFRP1Q13795 201 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 RFX4Q33E94 735 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 TMEM255AQ5JRV8 349 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 TEX30Q5JUR7 227 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 C1orf94Q6P1W5 598 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 BRD3OSQ6XYD6 125 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 PROKR2Q8NFJ6 384 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 OR4C13Q8NGP0 309 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 SLC7A13Q8TCU3 470 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 IL22RA2Q969J5 263 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 TBX15Q96SF7 602 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 MICU1Q9BPX6 476 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 COPS4Q9BT78 406 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 CHRDL1Q9BU40 450 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 RTL8AQ9BWD3 113 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 GPR61Q9BZJ8 451 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 CHIAQ9BZP6 476 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 SIRPDQ9H106 197 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 OR52D1Q9H346 318 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 NIPAL2Q9H841 368 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 SAR1AQ9NR31 198 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 ZNRD1Q9P1U0 126 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 PITPNC1Q9UKF7 332 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 MPC1Q9Y5U8 109 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 LHFPL6Q9Y693 200 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 WSB1Q9Y6I7 421 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-241ENST00000496183 FFAR1O14842 300 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 NPFFO15130 113 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 OR10H3O60404 316 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 GADD45GO95257 159 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 LHBP01229 141 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 RBP4P02753 201 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 OPN1MWP04001 364 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 FABP3P05413 133 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 OPN1MW2P0DN77 364 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 OPN1MW3P0DN78 364 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 ZNF3P17036 446 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 HSD11B1P28845 292 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 PRDX6P30041 224 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 RRM2P31350 389 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 FMO3P31513 532 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 KIR2DS4P43632 304 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 CAV3P56539 151 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 TSPAN31Q12999 210 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 MAB21L1Q13394 359 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 HSP90B2PQ58FF3 399 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 ASPHD2Q6ICH7 369 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 DPY19L4Q7Z388 723 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 VMO1Q7Z5L0 202 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 VTCN1Q7Z7D3 282 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 CALHM1Q8IU99 346 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 OR6V1Q8N148 313 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 LY6G5BQ8NDX9 201 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 BHLHE23Q8NDY6 225 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 OR2T33Q8NG76 320 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 LRRC29Q8WV35 223 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 MBOAT4Q96T53 435 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 COMMD4Q9H0A8 199 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 TLNRD1Q9H1K6 362 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 VCXQ9H320 206 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 RERGLQ9H628 205 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 GORASP2Q9H8Y8 452 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 C1orf123Q9NWV4 160 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 DCAF16Q9NXF7 216 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 RASL12Q9NYN1 266 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 MAB21L2Q9Y586 359 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 LOC100653049A0A140TA62 436 aa2.82□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa2.82□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 ARRDC5A6NEK1 342 aa2.82□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 OR5B21A6NL26 309 aa2.82□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 RIIAD1A6NNX1 92 aa2.82□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 VGLL3A8MV65 326 aa2.82□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 H0YL77 283 aa2.82□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 NME4O00746 187 aa2.82□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 PIN1P1O15428 100 aa2.82□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 SNAI2O43623 268 aa2.82□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 KRT34O76011 436 aa2.82□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 CLIC3O95833 236 aa2.82□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 CST4P01036 141 aa2.82□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 IGHV3-48P01763 117 aa2.82□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 HLA-DPB1P04440 258 aa2.82□□□□□ -1.96
RBM39-241ENST00000496183 GSTT2P0CG29 244 aa2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms