RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491203.5

CNOT4-210, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 4

Gene CNOT4, Length 538 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-210ENST00000491203 HIVEP2P31629 2446 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 VPS13CQ709C8 3753 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 J3QR06 171 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 NPFFO15130 113 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 FSHBP01225 129 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 PMP2P02689 132 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 CSF1P09603 554 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 OR5H8P0DN80 308 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 HRH1P35367 487 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 INPP1P49441 399 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 LGALS4P56470 323 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 LINC00310P59036 64 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 TAS2R19P59542 299 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 BPIFB3P59826 476 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ZNF846Q147U1 533 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 MORN2Q502X0 79 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 MIDNQ504T8 468 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 UTF1Q5T230 341 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ZNF626Q68DY1 528 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 RDH8Q9NYR8 311 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 EHFQ9NZC4 300 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 A0A1W2PPE3 182 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ODF3BA8MYP8 253 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 INAFM1C9JVW0 142 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 M0QYG6 137 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 SLC31A2O15432 143 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 LANCL1O43813 399 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 IFNA6P05013 189 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 TBPP20226 339 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 IL3RAP26951 378 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 HTR1DP28221 377 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 FCGR2CP31995 323 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 SAA4P35542 130 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 RAB7AP51149 207 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 AP3S2P59780 193 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 SCGB2A2Q13296 93 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 LSAMPQ13449 338 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 DYRK1AQ13627 763 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 VAX1Q5SQQ9 334 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 TRIQKQ629K1 86 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 LINC00311Q8N616 119 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 TRIM63Q969Q1 353 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 MMP28Q9H239 520 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 LEUTXA8MZ59 168 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 J3QRK9 145 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ITGB1BP1O14713 200 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 RAB3DO95716 219 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 IGLV1-47P01700 117 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 CD74P04233 296 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 CD3DP04234 171 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 AKAIN1P0CW23 69 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 SRD5A1P18405 259 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 CD40LGP29965 261 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 CEACAM3P40198 252 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 RFX2P48378 723 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ZNF134P52741 427 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 PPP5CP53041 499 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 HERV-K104P61576 105 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 TSPAN5P62079 268 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 MEF2DQ14814 521 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 BAK1Q16611 211 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT4-210ENST00000491203 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms