RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 NARFLQ9H6Q4 476 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 UCP1P25874 307 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 GPR12P47775 334 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 CYCSP99999 105 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 Q5BKY6 102 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 RAB39BQ96DA2 213 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 IGHV4-39P01824 125 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF134P52741 427 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM268Q5VZI3 342 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF695Q8IW36 515 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF525Q8N782 197 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 C18orf12Q96KH6 178 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM56Q96MV1 263 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 G3V3Q6 166 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 SERPINE2P07093 398 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 LHFPL5Q8TAF8 219 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 SDHAF2Q9NX18 166 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 DOCK11Q5JSL3 2073 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1W2PPH5 198 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 CDS2O95674 445 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 GNB2P62879 340 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 Q3ZCU0 254 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 CT45A1Q5HYN5 189 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 UTF1Q5T230 341 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 GGNBP1Q5YKI7 109 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 LYZL2Q7Z4W2 148 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 OR11H4Q8NGC9 324 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 CT45A3Q8NHU0 189 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 C5orf30Q96GV9 206 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 NMES1Q9C002 83 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 IFI27L2Q9H2X8 130 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 COMMD9Q9P000 198 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 MPTX1A8MV57 137 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 DLX6P56179 175 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 FGL1Q08830 312 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 C2orf50Q96LR7 162 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 F5H0A9 414 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 SLC31A2O15432 143 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 ERVFRD-1P60508 538 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 CATR1Q13166 79 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 BTNL3Q6UXE8 466 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 SLC35G3Q8N808 338 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF439Q8NDP4 499 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 OR10C1Q96KK4 312 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 TMED3Q9Y3Q3 217 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 GNG10P50151 68 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 PDLIM4P50479 330 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF66Q6ZN08 573 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 C8orf46Q8TAG6 207 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 IL22RA2Q969J5 263 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXB3-210ENST00000489475 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1W2PPE3 182 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 PPIAL4GP0DN37 164 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 ESCO2Q56NI9 601 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 GSKIPQ9P0R6 139 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 GAB2Q9UQC2 676 aa22■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 C17orf98A8MV24 154 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 RAB29O14966 203 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 ATP5J2P56134 94 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 GRPEL2Q8TAA5 225 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 BPESC1Q9GZL8 116 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 IGHV1-8P0DP01 117 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 COL8A1P27658 744 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 RPL30P62888 115 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 LYG1Q8N1E2 194 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 M0R1X1 148 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 LIPFP07098 398 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 RPL39P5Q59GN2 51 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 LY6G5BQ8NDX9 201 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 LOC105371242A0A075B767 164 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 PROP1O75360 226 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 VDAC1P21796 283 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 PSMB6P28072 239 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF585BQ52M93 769 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 C11orf42Q8N5U0 333 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXB3-210ENST00000489475 SESN1Q9Y6P5 492 aa21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms