RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475302.1

ITGA6-210, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA6, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-210ENST00000475302 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 SPINT2O43291 252 aa7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 B3GALNT1O75752 331 aa7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 MMP23AO75900 390 aa7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 IGKV1-39P01597 117 aa7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 IGHV2-70P01814 119 aa7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 IGKV1D-39P04432 117 aa7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 HOXB5P09067 269 aa7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 RPA2P15927 270 aa7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 PSMB6P28072 239 aa7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 DLX6P56179 175 aa7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 FGL1Q08830 312 aa7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 NMSQ5H8A3 153 aa7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 CMTM1Q8IZ96 169 aa7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 C19orf12Q9NSK7 152 aa7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 CALYQ9NYX4 217 aa7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 NBASA2RRP1 2371 aa7.96□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 C5orf51A6NDU8 294 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 A6NNC1 897 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 LYNX1G3V0Z9 82 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 HSPA12AO43301 675 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 PAX4O43316 350 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 NDUFA2O43678 99 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 PITX3O75364 302 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 P0C879 139 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 LYNX1P0DP58 116 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 RPL30P62888 115 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 SRPXP78539 464 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 HFEQ30201 348 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 SLC35G3Q8N808 338 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 TAS2R3Q9NYW6 316 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 TMED3Q9Y3Q3 217 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 ROS1P08922 2347 aa7.95□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 NKX6-3A6NJ46 265 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 FAM25EA8MYX2 175 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 OVOL3O00110 214 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 DVL1O14640 695 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 ARPC5O15511 151 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 TNFSF12O43508 249 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 GOSR1O95249 250 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 SSTR2P30874 369 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 EDDM3BP56851 147 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 RAB32Q13637 225 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF345Q14585 488 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF273Q14593 569 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 OPCMLQ14982 345 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 CT45A1Q5HYN5 189 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 TMEM268Q5VZI3 342 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 PRSS54Q6PEW0 395 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 TMUB2Q71RG4 321 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 KCNRGQ8N5I3 272 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 OR10A7Q8NGE5 316 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 CT45A3Q8NHU0 189 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 MBD2Q9UBB5 411 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 RNF150Q9ULK6 438 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.94□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 A0A087X0M5 115 aa7.93□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.93□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 A0A0G2JRQ6 117 aa7.93□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 A0A1B0GX30 115 aa7.93□□□□□ -1.14
ITGA6-210ENST00000475302 hADV38S2A0JD32 116 aa7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms