RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 DCKP27707 260 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 TPPP2P59282 170 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 PITPNAQ00169 270 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 GPR176Q14439 515 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 C6orf141Q5SZD1 244 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 STEAP3Q658P3 488 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 PPP1R27Q86WC6 154 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 LFNGQ8NES3 379 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 OR2AK2Q8NG84 335 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 SETD6Q8TBK2 473 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 CITED4Q96RK1 184 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 NICN1Q9BSH3 213 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 ZMAT4Q9H898 229 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 S100A14Q9HCY8 104 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 RETNQ9HD89 108 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 OR1A1Q9P1Q5 309 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 JPT1Q9UK76 154 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 RNF150Q9ULK6 438 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 H0YJW9 148 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 H7C2Y5 167 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 YPEL1O60688 119 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 HTR2CP28335 458 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 CAPGP40121 348 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 HMGN3Q15651 99 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 ACTBL2Q562R1 376 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 YIF1BQ5BJH7 314 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 ZFP1Q6P2D0 407 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 TRAT1Q6PIZ9 186 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 PQLC1Q8N2U9 271 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 OR5T1Q8NG75 326 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 GRPEL2Q8TAA5 225 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 CYGBQ8WWM9 190 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 GGHQ92820 318 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 GALMQ96C23 342 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 YPEL2Q96QA6 119 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 OR4C12Q96R67 309 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 RAB9BQ9NP90 201 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ACTB-209ENST00000473257 A0A0A6YYD4 124 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 DYNC1I1O14576 645 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 PROP1O75360 226 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 CA2P00918 260 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 TRGV3P03979 118 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 OR8U9P0C7N5 309 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 HTD2P86397 168 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 ST3GAL4Q11206 333 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 PSG5Q15238 335 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 LAIR2Q6ISS4 152 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 SVOPQ8N4V2 548 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 ZNF555Q8NEP9 628 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 TMEM80Q96HE8 168 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 RHOVQ96L33 236 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 CST11Q9H112 138 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 FAM90A7PA6NKC0 464 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 LDLRAD4O15165 306 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 CA11O75493 328 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 TRBV12-3P01733 135 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 IGKV1-16P04430 117 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 APELAP0DMC3 54 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 ARSBP15848 533 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 CELP19835 753 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 UNC119Q13432 240 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 IL34Q6ZMJ4 242 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 NEDD4LQ96PU5 975 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 GHITMQ9H3K2 345 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 SLC23A1Q9UHI7 598 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 ERGIC3Q9Y282 383 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 SLC25A17O43808 307 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 RGS11O94810 467 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 IGLV1-51P01701 117 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 GLAP06280 429 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 GNAO1P09471 354 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 SYNJ2BPP57105 145 aa8.56□□□□□ -1.04
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