RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	DHRS2	Q13268	280 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP1R1A	Q13522	171 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	GNMT	Q14749	295 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	C4orf46	Q504U0	113 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	LRTM2	Q8N967	370 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	UBALD1	Q8TB05	177 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	TOMM40L	Q969M1	308 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	PSG11	Q9UQ72	335 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	RAB29	O14966	203 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	PROP1	O75360	226 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	AKR1C4	P17516	323 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF137P	P52743	207 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	ERVFRD-1	P60508	538 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	BAMBI	Q13145	260 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	DRAM1	Q8N682	238 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529		Q8N7P7	452 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	OR9G1	Q8NH87	305 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	NAA60	Q9H7X0	242 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	MED13L	Q71F56	2210 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	HIVEP1	P15822	2718 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	ARID1A	O14497	2285 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	DBX1	A6NMT0	343 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF212B	A8MTL3	300 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529		J3QR06	171 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	IGLV1-47	P01700	117 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	ANXA3	P12429	323 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	PI3	P19957	117 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	F2R	P25116	425 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	PRRX1	P54821	245 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	PAX8	Q06710	450 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM56	Q96MV1	263 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	SIRPD	Q9H106	197 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529		B4DSR2	109 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	CDS2	O95674	445 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	IFNA2	P01563	188 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	GATA3	P23771	443 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	NFYB	P25208	207 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	UCP1	P25874	307 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	SRPX	P78539	464 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM187	Q14656	261 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	ASB13	Q8WXK3	278 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	IL22RA2	Q969J5	263 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM186	Q96B77	213 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	PHB2	Q99623	299 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	BEX2	Q9BXY8	128 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	MED28	Q9H204	178 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2D2	Q9H210	308 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	BEX1	Q9HBH7	125 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF150	Q9ULK6	438 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		10.4	□□□□□ -0.74
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM157A	C9JC47	383 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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