RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466638.5

PNCK-222, Transcript of pregnancy up-regulated nonubiquitous CaM kinase, human

TSL 2

Gene PNCK, Length 1,204 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNCK-222	ENST00000466638	EBI3	Q14213	229 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PNCK-222	ENST00000466638	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PNCK-222	ENST00000466638	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PNCK-222	ENST00000466638	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PNCK-222	ENST00000466638	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PNCK-222	ENST00000466638	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PNCK-222	ENST00000466638	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PNCK-222	ENST00000466638	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
PNCK-222	ENST00000466638	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
PNCK-222	ENST00000466638	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
PNCK-222	ENST00000466638	RDH8	Q9NYR8	311 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PNCK-222	ENST00000466638	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638		A0A0A6YYH2	397 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638		A6NJ64	397 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	RAB29	O14966	203 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	GABARAP	O95166	117 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	MOS	P00540	346 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	DTYMK	P23919	212 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	PITPNA	Q00169	270 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	IGSF11	Q5DX21	431 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	GPR107	Q5VW38	600 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	GPR141	Q7Z602	305 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638		Q8N6K4	173 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	S1PR3	Q99500	378 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	DIABLO	Q9NR28	239 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	FGF16	O43320	207 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	TFAP2A	P05549	437 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	ALDH3B2	P48448	385 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	CTF1	Q16619	201 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638		Q6ZS49	121 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	NABP2	Q9BQ15	211 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	RNF150	Q9ULK6	438 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	SSX5	O60225	188 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	DIRAS3	O95661	229 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	PRR31	Q5SQ13	230 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	GINS4	Q9BRT9	223 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	ABCG5	Q9H222	651 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	GHITM	Q9H3K2	345 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	ZNF221	Q9UK13	617 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638		M0QZ24	198 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	GPR12	P47775	334 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	XRCC3	O43542	346 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	FBXO24	O75426	580 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	CT45A6	P0DMU7	189 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	CT45A5	P0DMU8	189 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	CT45A7	P0DMV0	189 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	RORC	P51449	518 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	F2RL1	P55085	397 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638		Q8N9W7	124 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	OR2D2	Q9H210	308 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	OR8U9	P0C7N5	309 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	CD28	P10747	220 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	PTHLH	P12272	177 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	ACTB	P60709	375 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	MMD	Q15546	238 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	OR8U1	Q8NH10	309 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PNCK-222	ENST00000466638	OR5H14	A6NHG9	310 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PNCK-222	ENST00000466638	CTXN2	P0C2S0	81 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PNCK-222	ENST00000466638	CNIH2	Q6PI25	160 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PNCK-222	ENST00000466638	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PNCK-222	ENST00000466638	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32

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