RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 DNAH1Q9P2D7 4330 aa20.32■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 RRHO14718 337 aa20.31■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 DOC2BQ14184 412 aa20.31■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 HMGN3Q15651 99 aa20.31■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 LRRC36Q1X8D7 754 aa20.31■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 FAM131AQ6UXB0 335 aa20.31■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 CASTOR1Q8WTX7 329 aa20.31■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 UQCC2Q9BRT2 126 aa20.31■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 FBXL15Q9H469 300 aa20.31■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 GHRLQ9UBU3 117 aa20.31■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 STEAP1Q9UHE8 339 aa20.31■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 LDLRAD4O15165 306 aa20.3■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 PLGLAQ15195 96 aa20.3■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF485Q8NCK3 441 aa20.3■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM80Q96HE8 168 aa20.3■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 DERL3Q96Q80 235 aa20.3■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 ABRACLQ9P1F3 81 aa20.3■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 A3GALT2U3KPV4 340 aa20.3■□□□□ 0.84
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PBRM1-218ENST00000458294 ABHD5Q8WTS1 349 aa20.29■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 FAM46BQ96A09 425 aa20.29■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 BAG2O95816 211 aa20.28■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 MC5RP33032 325 aa20.28■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 TAS2R43P59537 309 aa20.28■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 AKIRIN2Q53H80 203 aa20.28■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 ACTBL2Q562R1 376 aa20.28■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 PQLC1Q8N2U9 271 aa20.28■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 ELOVL1Q9BW60 279 aa20.28■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 SLA2Q9H6Q3 261 aa20.28■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 A8MZ25 164 aa20.27■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 ST8SIA5O15466 376 aa20.27■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 HSPA12AO43301 675 aa20.27■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 RBBP9O75884 186 aa20.27■□□□□ 0.84
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PBRM1-218ENST00000458294 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa20.27■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 CD40LGP29965 261 aa20.27■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 PPP1R27Q86WC6 154 aa20.27■□□□□ 0.84
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PBRM1-218ENST00000458294 ISOC1Q96CN7 298 aa20.27■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 RHOVQ96L33 236 aa20.27■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 NEDD4LQ96PU5 975 aa20.27■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 SULT4A1Q9BR01 284 aa20.27■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 S100A14Q9HCY8 104 aa20.27■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 SLC23A1Q9UHI7 598 aa20.27■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 STUB1Q9UNE7 303 aa20.27■□□□□ 0.84
PBRM1-218ENST00000458294 FCN1O00602 326 aa20.26■□□□□ 0.83
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PBRM1-218ENST00000458294 CT45A7P0DMV0 189 aa20.26■□□□□ 0.83
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PBRM1-218ENST00000458294 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa20.26■□□□□ 0.83
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PBRM1-218ENST00000458294 IL1F10Q8WWZ1 152 aa20.26■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 RNF5Q99942 180 aa20.26■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 EDA2RQ9HAV5 297 aa20.26■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 H0YJW9 148 aa20.25■□□□□ 0.83
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PBRM1-218ENST00000458294 RPL39P5Q59GN2 51 aa20.25■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 SGPP2Q8IWX5 399 aa20.25■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 C19orf73Q9NVV2 129 aa20.25■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 WASHC3Q9Y3C0 194 aa20.25■□□□□ 0.83
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PBRM1-218ENST00000458294 ZNF562Q6V9R5 426 aa20.24■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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PBRM1-218ENST00000458294 ITGB1BP1O14713 200 aa20.23■□□□□ 0.83
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PBRM1-218ENST00000458294 ZNF880Q6PDB4 577 aa20.22■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 MOB1BQ7L9L4 216 aa20.22■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 C6orf201Q7Z4U5 140 aa20.22■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 HAPLN4Q86UW8 402 aa20.22■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 RSRP1Q9BUV0 290 aa20.22■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 EFCAB10A6NFE3 127 aa20.21■□□□□ 0.83
PBRM1-218ENST00000458294 SLC22A1O15245 554 aa20.21■□□□□ 0.83
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PBRM1-218ENST00000458294 CELP19835 753 aa20.21■□□□□ 0.83
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