RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 EBAG9O00559 213 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 FCN1O00602 326 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYL12BO14950 172 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC22A1O15245 554 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 CDK1P06493 297 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 CT45A6P0DMU7 189 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 CT45A5P0DMU8 189 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 CT45A7P0DMV0 189 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR5H8P0DN80 308 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB9AP51151 201 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM50BP56557 158 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00205P59089 165 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF616Q08AN1 781 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 MED21Q13503 144 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 IRF3Q14653 427 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 RCN1Q15293 331 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNLSQ5VYX0 342 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 DCUN1D4Q92564 292 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR5B12Q96R08 314 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASCL2Q99929 193 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 FBXL15Q9H469 300 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 C8orf4Q9NR00 106 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 PARP11Q9NR21 331 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 GHRLQ9UBU3 117 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 GAB2Q9UQC2 676 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 RYR2Q92736 4967 aa6.53□□□□□ -1.36
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A087WW49 117 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 H0YJW9 148 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 ITGB1BP1O14713 200 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 RRHO14718 337 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 SOCS1O15524 211 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLURP1P55000 103 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 CX3CL1P78423 397 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR20EP86478 221 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR20CP86479 221 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR20DP86480 221 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR20BP86481 221 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR20AP86496 221 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 ECSCRQ19T08 205 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 PHYHIPQ92561 330 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 GALMQ96C23 342 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 CST11Q9H112 138 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 VSIG4Q9Y279 399 aa6.52□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1W2PN81 502 aa6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR5H14A6NHG9 310 aa6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 OVOL1O14753 267 aa6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 UCHL1P09936 223 aa6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR8U8P0C7N1 319 aa6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBBP0CG47 229 aa6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 SRMP19623 302 aa6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHRNA7P36544 502 aa6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 INSL3P51460 131 aa6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 HLA-DRB3P79483 266 aa6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLA2G7Q13093 441 aa6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 LIN54Q6MZP7 749 aa6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 THRSPQ92748 146 aa6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 C5orf30Q96GV9 206 aa6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMED9Q9BVK6 235 aa6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms