RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	LY6L	H3BQJ8	138 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	ITGB1BP1	O14713	200 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	HSD17B6	O14756	317 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	RAB29	O14966	203 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPR12	P47775	334 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	INPP1	P49441	399 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	RAB13	P51153	203 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARHGDIB	P52566	201 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	FXYD4	P59646	89 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	BAMBI	Q13145	260 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	DYRK1A	Q13627	763 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACTBL2	Q562R1	376 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402		Q6YL49	198 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	S100Z	Q8WXG8	99 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	DUX5	Q96PT3	197 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	S1PR3	Q99500	378 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	SRR	Q9GZT4	340 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR2D2	Q9H210	308 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	RAB3D	O95716	219 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	IFNA2	P01563	188 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	AADAC	P22760	399 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	HERV-K104	P61576	105 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	MOB3B	Q86TA1	216 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	GHITM	Q9H3K2	345 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	11.06	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	BTBD17	A6NE02	478 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPY	P01298	95 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGHV4-59	P01825	116 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	AKAIN1	P0CW23	69 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	CD24	P25063	80 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIQK	Q629K1	86 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM17	Q86X19	198 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	MFSD4A	Q8N468	514 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	OOSP1	A8MZH6	123 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402		H3BUX3	64 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	TIMM23	O14925	209 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	TCF21	O43680	179 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	TUSC2	O75896	110 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	AMY2A	P04746	511 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	TBP	P20226	339 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	BRS3	P32247	399 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	IER3	P46695	156 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF137P	P52743	207 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	AP3S2	P59780	193 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	BAK1	Q16611	211 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR56B4	Q8NH76	319 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402		M0R1X1	148 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	TXNL1	O43396	289 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	CD74	P04233	296 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	MEF2D	Q14814	521 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	LY6E	Q16553	131 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR8H3	Q8N146	312 aa		11.04	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms