RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 MTORP42345 2549 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF735P0CB33 412 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 IGKV1-13P0DP09 117 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 HTR1DP28221 377 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 SAA4P35542 130 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 IFITM3Q01628 133 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 TOMM40LQ969M1 308 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 MOB3AQ96BX8 217 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 ABHD14BQ96IU4 210 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 PRRT1Q99946 306 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 OR2D2Q9H210 308 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 NUP50Q9UKX7 468 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 FSHBP01225 129 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 IL3RAP26951 378 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 SRP14P37108 136 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 MIDNQ504T8 468 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 PIP4P2Q8N4L2 257 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 SECTM1Q8WVN6 248 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 CREB3L1Q96BA8 519 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 AGMATQ9BSE5 352 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM160Q9NX00 188 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 NAV3Q8IVL0 2385 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 LYRM1O43325 122 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 GPR12P47775 334 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 IDO2Q6ZQW0 420 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 LDLRAD3Q86YD5 345 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 FAM216AQ8WUB2 273 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 FXYD6Q9H0Q3 95 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF221Q9UK13 617 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 NAP1L6A6NFF2 107 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 OR5H14A6NHG9 310 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 LEUTXA8MZ59 168 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 RAB29O14966 203 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 PLA2G10O15496 165 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 EPHA1P21709 976 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 AADACL3Q5VUY0 350 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 LHFPL1Q86WI0 220 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 TERB2Q8NHR7 220 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 SLC5A7Q9GZV3 580 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 PIPOXQ9P0Z9 390 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 TBC1D24Q9ULP9 559 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 CEACAM3P40198 252 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 BPIFB3P59826 476 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 MINOS1Q5TGZ0 78 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 ODF3L1Q8IXM7 274 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 RPEQ96AT9 228 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 SLC2A8Q9NY64 477 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 DPM3Q9P2X0 92 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXA4-202ENST00000428284 ASAH1Q13510 395 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 RPL39P5Q59GN2 51 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF645Q8N7E2 425 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 C17orf50Q8WW18 174 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 GHITMQ9H3K2 345 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 HILPDAQ9Y5L2 63 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 HSD17B6O14756 317 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 PGAM2P15259 253 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 DEFA1P59665 94 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 DEFA3P59666 94 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 BAMBIQ13145 260 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 SSX2Q16385 188 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 C22orf15Q8WYQ4 148 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 S1PR3Q99500 378 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 BEX2Q9BXY8 128 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 CCL28Q9NRJ3 127 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 FAM96BQ9Y3D0 163 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 A0A0U1RQK1 487 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 REG1BP48304 166 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 CCR6P51684 374 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF137PP52743 207 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 MZT2BQ6NZ67 158 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 OR13C8Q8NGS7 320 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 PALMDQ9NP74 551 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 SDHAF2Q9NX18 166 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 INAFM1C9JVW0 142 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 LY6LH3BQJ8 138 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 SLC22A5O76082 557 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 PAX6P26367 422 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 BTCP35070 178 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 ECI1P42126 302 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 SLC38A6Q8IZM9 456 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXA4-202ENST00000428284 DRAM1Q8N682 238 aa16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms