RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM80Q96HE8 168 aa14.9□□□□□ -0.02
UBXN4-202ENST00000415164 PGLYRP3Q96LB9 341 aa14.9□□□□□ -0.02
UBXN4-202ENST00000415164 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.9□□□□□ -0.02
UBXN4-202ENST00000415164 SORL1Q92673 2214 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 LCE6AA0A183 80 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 FCN1O00602 326 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 DYNC1I1O14576 645 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 RRHO14718 337 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 GLAP06280 429 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 CD40LGP29965 261 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 DOC2BQ14184 412 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 CITED4Q96RK1 184 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 IFI27L2Q9H2X8 130 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 RNF150Q9ULK6 438 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 GAB2Q9UQC2 676 aa14.89□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 LDLRAD4O15165 306 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 PYHIN1Q6K0P9 492 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 SGPP2Q8IWX5 399 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 C10orf67Q8IYJ2 551 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 LFNGQ8NES3 379 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 CYGBQ8WWM9 190 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 ISOC1Q96CN7 298 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 DERL3Q96Q80 235 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 SULT4A1Q9BR01 284 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 FAAP24Q9BTP7 215 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 DNAH1Q9P2D7 4330 aa14.88□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 STARD9Q9P2P6 4700 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 RAB29O14966 203 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 TRGV3P03979 118 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 CT45A6P0DMU7 189 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 CT45A5P0DMU8 189 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 CT45A7P0DMV0 189 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 HMGN3Q15651 99 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 C19orf54Q5BKX5 351 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 OR10K2Q6IF99 312 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 PQLC1Q8N2U9 271 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 NKAIN3Q8N8D7 197 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 ABHD14BQ96IU4 210 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 S100A14Q9HCY8 104 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 STUB1Q9UNE7 303 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 LRRC42Q9Y546 428 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 BIRC6Q9NR09 4857 aa14.87□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 CA2P00918 260 aa14.86□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 ARSBP15848 533 aa14.86□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 CELP19835 753 aa14.86□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 TAS2R43P59537 309 aa14.86□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 C6orf201Q7Z4U5 140 aa14.86□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 CDH26Q8IXH8 852 aa14.86□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 GRPEL2Q8TAA5 225 aa14.86□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 TPSG1Q9NRR2 321 aa14.86□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.86□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.86□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 WASHC3Q9Y3C0 194 aa14.86□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 LYSTQ99698 3801 aa14.86□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 OR5H14A6NHG9 310 aa14.85□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 H0YJW9 148 aa14.85□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 FAM71F2Q6NXP2 309 aa14.85□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 TM2D3Q9BRN9 247 aa14.85□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 UQCC2Q9BRT2 126 aa14.85□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 KCNK15Q9H427 330 aa14.85□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.84□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 ANKRD34BA5PLL1 514 aa14.84□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 MYL12BO14950 172 aa14.84□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 HSPA12AO43301 675 aa14.84□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 CPEP16870 476 aa14.84□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 MC5RP33032 325 aa14.84□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 ST3GAL4Q11206 333 aa14.84□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.84□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.84□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa14.84□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 GGHQ92820 318 aa14.84□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM59Q9BXS4 323 aa14.84□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 GHRLQ9UBU3 117 aa14.84□□□□□ -0.03
UBXN4-202ENST00000415164 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 RPS16P62249 146 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 PSG5Q15238 335 aa14.83□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 AKIRIN2Q53H80 203 aa14.83□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 LYPD6Q86Y78 171 aa14.83□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 SVOPQ8N4V2 548 aa14.83□□□□□ -0.04
UBXN4-202ENST00000415164 RHOVQ96L33 236 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.8 ms