RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 PCM1Q15154 2024 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ASPDHA6ND91 283 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 M0QZ24 198 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 RER1O15258 196 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 GPANK1O95872 356 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 P01737 135 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SEMG1P04279 462 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 IER3P46695 156 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 FBLN7Q53RD9 439 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF880Q6PDB4 577 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR8I2Q8N0Y5 310 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR10G4Q8NGN3 311 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR10G9Q8NGN4 311 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR10G7Q8NGN6 311 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR5C1Q8NGR4 320 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR6X1Q8NH79 312 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SMIM19Q96E16 107 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 PERPQ96FX8 193 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 RHNO1Q9BSD3 238 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM147Q9BVK8 224 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 MAGT1Q9H0U3 335 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SH2D2AQ9NP31 389 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF391Q9UJN7 358 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TINAGQ9UJW2 476 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR2W1Q9Y3N9 320 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 LIPT2A6NK58 231 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 LINC00587B1AMM8 73 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TRDCB7Z8K6 153 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SFT2D2O95562 160 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TRGC2P03986 189 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 PRSS2P07478 247 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 NGFRP08138 427 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 HKR1P10072 659 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 IAPPP10997 89 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 HRH1P35367 487 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 RIPPLY3P57055 190 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC38A11Q08AI6 406 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 GAMTQ14353 236 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SNAI3Q3KNW1 292 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TCF23Q7RTU1 214 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SGMS2Q8NHU3 365 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF502Q8TBZ5 544 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SFXN3Q9BWM7 321 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 CNTD2Q9H8S5 307 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 GPR84Q9NQS5 396 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 CES1P1Q9UKY3 287 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 STARD10Q9Y365 291 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SCN3AQ9NY46 2000 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 C11orf94C9JXX5 98 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC17A2O00624 439 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 DLEU1O43261 78 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 COL8A1P27658 744 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 P2RY1P47900 373 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TNFSF10P50591 281 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM33P57088 247 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ACSM6Q6P461 480 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TRAT1Q6PIZ9 186 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR52B4Q8NGK2 314 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR2K2Q8NGT1 345 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM56Q96MV1 263 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa3.85□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 PI4KAP42356 2102 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 COL4A6Q14031 1691 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A0J9YW62 118 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 PLPP3O14495 311 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 HPRT1P00492 218 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 HPXP02790 462 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 FAHP16930 419 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 GNG3P63215 75 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 EGR3Q06889 387 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 CDK5R1Q15078 307 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 TBR1Q16650 682 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM71F2Q6NXP2 309 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 LIAT1Q6ZQX7 453 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 MOGAT3Q86VF5 341 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 OR52E5Q8NH55 327 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 GHITMQ9H3K2 345 aa3.84□□□□□ -1.79
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms