RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379599.6

NHLRC3-201, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLRC3, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-201ENST00000379599 GATSQ8NAP1 163 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF114Q8NC26 417 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 LMX1AQ8TE12 382 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC22A20A6NK97 555 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 J3QR89 54 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 M0R2Z0 102 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 BRI3O95415 125 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 SSTR5P35346 364 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 TIMP3P35625 211 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 GPM6AP51674 278 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC35B1P78383 322 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 OR52N5Q8NH56 324 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 TSKUQ8WUA8 353 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 LINC00470Q9BZP3 86 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 SERTAD4Q9NUC0 356 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 PSG8Q9UQ74 426 aa7.28□□□□□ -1.24
NHLRC3-201ENST00000379599 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 H0YJW9 148 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF823P16415 610 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 IGFBP2P18065 325 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 UBE2G1P62253 170 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 LRTM2Q8N967 370 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 JMJD8Q96S16 334 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 OR4C46A6NHA9 309 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 ISLRO14498 428 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 NAPSAO96009 420 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC25A6P12236 298 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 ID1P41134 155 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 NPBWR2P48146 333 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 HERV-K104P61576 105 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 ROM1Q03395 351 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 MGAT2Q10469 447 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM53BQ14153 422 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 NRN1LQ496H8 165 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 CDRT4Q8N9R6 151 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 DPF1Q92782 380 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 GPHA2Q96T91 129 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 RNF208Q9H0X6 261 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 MMP25Q9NPA2 562 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa7.27□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 F2RL2O00254 374 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 MPPED1O15442 326 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 NEURL1O76050 574 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 TSPAN13O95857 204 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 VDAC1P21796 283 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 NPPCP23582 126 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 HTR1DP28221 377 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 NOGQ13253 232 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 NNATQ16517 81 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 NAT6Q93015 286 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 RNF183Q96D59 192 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 B5MCH6 92 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 MLNRO43193 412 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 SRFP11831 508 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 GPR183P32249 361 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 RPS18P62269 152 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 RNF133Q8WVZ7 376 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 C8orf44Q96CB5 159 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 ULBP2Q9BZM5 246 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 METTL7AQ9H8H3 244 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 FREM3P0C091 2139 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 A0A0G2JLM5 398 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 C9orf118A6NHY6 69 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 CD70P32970 193 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 RHOBP62745 196 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 SERF2P84101 59 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 AESQ08117 197 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 TXNDC8Q6A555 127 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 OR51E1Q8TCB6 317 aa7.26□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.25□□□□□ -1.25
NHLRC3-201ENST00000379599 OR11H12B2RN74 326 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms