RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368215.7

PTPRK-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 4,651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-206ENST00000368215 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-206ENST00000368215 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-206ENST00000368215 CHD7Q9P2D1 2997 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-206ENST00000368215 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.21□□□□□ -1.26
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PTPRK-206ENST00000368215 MPZP25189 248 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-206ENST00000368215 CD82P27701 267 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-206ENST00000368215 CHRNA7P36544 502 aa7.21□□□□□ -1.26
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PTPRK-206ENST00000368215 CLDN14O95500 239 aa7.2□□□□□ -1.26
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PTPRK-206ENST00000368215 F6UZH7 168 aa7.2□□□□□ -1.26
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PTPRK-206ENST00000368215 IGHV1-2P23083 117 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRK-206ENST00000368215 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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PTPRK-206ENST00000368215 OR4C12Q96R67 309 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRK-206ENST00000368215 DCTN5Q9BTE1 182 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRK-206ENST00000368215 REG4Q9BYZ8 158 aa7.2□□□□□ -1.26
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PTPRK-206ENST00000368215 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-206ENST00000368215 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-206ENST00000368215 RNF7Q9UBF6 113 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRK-206ENST00000368215 CECR9P0C854 216 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRK-206ENST00000368215 RND3P61587 244 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRK-206ENST00000368215 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-206ENST00000368215 RBKSQ9H477 322 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRK-206ENST00000368215 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-206ENST00000368215 OR4S2Q8NH73 311 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-206ENST00000368215 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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PTPRK-206ENST00000368215 TUBD1Q9UJT1 453 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRK-206ENST00000368215 TSTD3H0UI37 97 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-206ENST00000368215 ZG16O60844 167 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-206ENST00000368215 UCP1P25874 307 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-206ENST00000368215 RAB7AP51149 207 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-206ENST00000368215 P2RY6Q15077 328 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-206ENST00000368215 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-206ENST00000368215 NRN1LQ496H8 165 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-206ENST00000368215 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-206ENST00000368215 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.18□□□□□ -1.26
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