RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 MKRN2OSH3BPM6 223 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANGP03950 147 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPPCP23582 126 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 KDELR2P33947 212 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSMD7P51665 324 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00313P59037 77 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 XKRXQ6PP77 449 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLCZ1Q86YW0 608 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR52E4Q8NGH9 312 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5AK3PQ8NH89 298 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMIM12Q96EX1 92 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACY3Q96HD9 319 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDUFB11Q9NX14 153 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLS2Q9UI32 602 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAJC12Q9UKB3 198 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNX10Q9Y5X0 201 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLCH2O75038 1416 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 PXDNLA1KZ92 1463 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa0.78□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 DSCAML1Q8TD84 2053 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 SIGLEC16A6NMB1 481 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 GOLGA8RI6L899 631 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC17A3O00476 420 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZW10O43264 779 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNRH2O43555 120 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARL6IP5O75915 188 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASS1P00966 412 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR13C7P0DN81 318 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALOX5APP20292 161 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRHBPP24387 322 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADORA1P30542 326 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 DAD1P61803 113 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 XRCC4Q13426 336 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 TPRXLQ17RH7 258 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLEC12BQ2HXU8 276 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBC1D28Q2M2D7 210 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCGB1D4Q6XE38 83 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF283Q8N7M2 679 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR7D2Q96RA2 312 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR22Q99680 433 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACBD6Q9BR61 282 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 MED10Q9BTT4 135 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNB1LQ9BYB4 327 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR51B6Q9H340 312 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 TREM1Q9NP99 234 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1orf109Q9NX04 203 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRO2289Q9P1D8 64 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNX12Q9UMY4 172 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 CACNA1SQ13698 1873 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARRDC5A6NEK1 342 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 C11orf86A6NJI1 115 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM25EA8MYX2 175 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 HBZP02008 142 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCL3P10147 92 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFL1P23528 166 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 F8A1P23610 371 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRYBB3P26998 211 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 DAPP51397 102 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAS2R45P59539 299 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLAMF1Q13291 335 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM45BPQ6NSW5 357 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 AGTRAPQ6RW13 159 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 C2orf91Q6ZV80 131 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC35F6Q8N357 371 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 NATD1Q8N6N6 113 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC112Q8NEF3 446 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR4X2Q8NGF9 303 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 STOML3Q8TAV4 291 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC45Q96CN5 670 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM208Q9BTX3 173 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 MS4A12Q9NXJ0 267 aa0.76□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATAD5Q96QE3 1844 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 FN1P02751 2386 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPATQ14207 1427 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5K4A6NMS3 321 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 IQCF5A8MTL0 148 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 C2orf74A8MZ97 194 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSBP1L1C9JCN9 74 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-552P-201ENST00000362869 F8VZ95 297 aa0.75□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms