RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 VPS13CQ709C8 3753 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 ROS1P08922 2347 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 TRAV39A0A0B4J263 110 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 TRAV20A0A0B4J274 112 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 B4DSR2 109 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 M0QYG6 137 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 NDUFB6O95139 128 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 GATA3P23771 443 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 CD34P28906 385 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 SSTR5P35346 364 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 RAG2P55895 527 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 OXA1LQ15070 435 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 AADACL3Q5VUY0 350 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 LPCAT3Q6P1A2 487 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 ZDHHC22Q8N966 263 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 BPIFCQ8NFQ6 507 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 OR51S1Q8NGJ8 323 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 OR56B4Q8NH76 319 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 CHPT1Q8WUD6 406 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 CAPSLQ8WWF8 208 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 EDARADDQ8WWZ3 215 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 MOB3AQ96BX8 217 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 SCGB3A2Q96PL1 93 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 NARFLQ9H6Q4 476 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 GFOD1Q9NXC2 390 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 PDZD2O15018 2839 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-202ENST00000317118 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 FAM157AC9JC47 383 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 BET1O15155 118 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 SLC22A5O76082 557 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 SNAPINO95295 136 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 IGHV1-8P0DP01 117 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 CEACAM6P40199 344 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 SLAQ13239 276 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 MORN2Q502X0 79 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 IDO2Q6ZQW0 420 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 LINC00311Q8N616 119 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 OR13C8Q8NGS7 320 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 Q96MF0 132 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 GINS4Q9BRT9 223 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 SLC5A7Q9GZV3 580 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 OR2S2Q9NQN1 319 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 MCUBQ9NWR8 336 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 OR2W1Q9Y3N9 320 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 INSIG2Q9Y5U4 225 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 CENPEQ02224 2701 aa4.84□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 AKAP9Q99996 3911 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 PPYP01298 95 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 MSMBP08118 114 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 CCL3L1P16619 93 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 PRTN3P24158 256 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 FCGR2CP31995 323 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 ERVFRD-1P60508 538 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 PAX8Q06710 450 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 FAAP20Q6NZ36 180 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 BTNL3Q6UXE8 466 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 NRARPQ7Z6K4 114 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 Q8N7P7 452 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 LINC01356Q8N9X3 169 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF439Q8NDP4 499 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 RFESDQ8TAC1 157 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 IL1F10Q8WWZ1 152 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 MRGPRFQ96AM1 343 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 CREB3L1Q96BA8 519 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 RNF125Q96EQ8 232 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 SEC22CQ9BRL7 303 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 SIRPDQ9H106 197 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 RDH8Q9NYR8 311 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 OR1A1Q9P1Q5 309 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 UNC79Q9P2D8 2635 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 FAM172BPA6NC97 362 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 OR5H14A6NHG9 310 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 HSPA12AO43301 675 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 TGFAP01135 160 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 TCRBP04435 133 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 MMP9P14780 707 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 AADACP22760 399 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 GZMKP49863 264 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 RAB7AP51149 207 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 LCN2P80188 198 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 C5orf24Q7Z6I8 188 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 OR52L2PQ8NGH6 319 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 ZFAND1Q8TCF1 268 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 AKR1E2Q96JD6 320 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 MARVELD1Q9BSK0 173 aa4.83□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 FXYD6Q9H0Q3 95 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.2 ms