RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 TMEM240Q5SV17 173 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 BEND2Q8NDZ0 799 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 SPSB4Q96A44 273 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 SLC25A28Q96A46 364 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 P2RY6Q15077 328 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 GNRHR2Q96P88 292 aa13.93□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 SSC5DA1L4H1 1573 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 H7C2G1 150 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 FAM216AQ8WUB2 273 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 TMEM106BQ9NUM4 274 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 TRAV39A0A0B4J263 110 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 LDLRAD4O15165 306 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 ASAH2BP0C7U1 165 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 PRNTQ86SH4 94 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 NUDT10Q8NFP7 164 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 RNF122Q9H9V4 155 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 PROCRQ9UNN8 238 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 LIPFP07098 398 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 STAG3L3P0CL85 134 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 LRRC29Q8WV35 223 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 LTBP4Q8N2S1 1624 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 CA1P00915 261 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 IL4P05112 153 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 AREGP15514 252 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 RPEQ96AT9 228 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 IMMP2LQ96T52 175 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 SIGMAR1Q99720 223 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 PHIPQ8WWQ0 1821 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 ARL14EPLP0DKL9 152 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 COX14Q96I36 57 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 KCNS1Q96KK3 526 aa13.92□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 LINC01387J3KSC0 135 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 K7ESF4 209 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 SNAI3Q3KNW1 292 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 C1QL4Q86Z23 238 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 SPEM1Q8N4L4 309 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 SLX1AQ9BQ83 275 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 ECM29Q5VYK3 1845 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 SPRY3O43610 288 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 PGLYRP4Q96LB8 373 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 CLEC1BQ9P126 229 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 C19orf67A6NJJ6 358 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 FAM90A26D6RGX4 464 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 F8VVB4 439 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 F8VWA3 439 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 MIC13Q5XKP0 118 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 CLDND2Q8NHS1 167 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 CLEC5AQ9NY25 188 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 HSPB7Q9UBY9 170 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 ADAMTSL3P82987 1691 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 A0A1B0GTI1 187 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 LMX1BO60663 402 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 ANKRD37Q7Z713 158 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 OR2I1PQ8NGU4 316 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 ATP23Q9Y6H3 246 aa13.91□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 MT-CO3P00414 261 aa13.9□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 UBTD1Q9HAC8 227 aa13.9□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 IL36BQ9NZH7 164 aa13.9□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 NDUFB3O43676 98 aa13.9□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 NDUFA2O43678 99 aa13.9□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 CKS2P33552 79 aa13.9□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 PYY3Q5JQD4 70 aa13.9□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 LRRC10Q5BKY1 277 aa13.9□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 A0A1W2PRS3 328 aa13.9□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 EGR1P18146 543 aa13.9□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa13.9□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa13.9□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa13.9□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 A0A1W2PPV9 198 aa13.9□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 J3QT63 122 aa13.9□□□□□ -0.18
CTIF-201ENST00000256413 TWIST1Q15672 202 aa13.89□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 SARGQ9BW04 601 aa13.89□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 A0A1W2PPC4 97 aa13.89□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 MS4A18H0YCH9 400 aa13.89□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 HRKO00198 91 aa13.89□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 SERF1AO75920 110 aa13.89□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 CRYBB3P26998 211 aa13.89□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 MS4A18Q3C1V0 323 aa13.89□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 GFI1BQ5VTD9 330 aa13.89□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 A0A0U1RQV5 110 aa13.89□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 SYNGR1O43759 233 aa13.89□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 GALNSP34059 522 aa13.89□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 NRN1Q9NPD7 142 aa13.89□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa13.89□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 H3BUT2 72 aa13.89□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 SCTP09683 121 aa13.89□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 SPINK2P20155 84 aa13.89□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 PRSS53Q2L4Q9 553 aa13.89□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 CXXC4Q9H2H0 198 aa13.89□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 SCN9AQ15858 1988 aa13.89□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 GZMHP20718 246 aa13.88□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 J3QR06 171 aa13.88□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 TNXAQ16473 311 aa13.88□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 LY6G6FQ5SQ64 297 aa13.88□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
CTIF-201ENST00000256413 MMP17Q9ULZ9 603 aa13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms