RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216420.11

CGRRF1-201, Transcript of cell growth regulator with ring finger domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CGRRF1, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
CGRRF1-201ENST00000216420 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
CGRRF1-201ENST00000216420 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa15.65■□□□□ 0.1
CGRRF1-201ENST00000216420 TXNDC17Q9BRA2 123 aa15.65■□□□□ 0.1
CGRRF1-201ENST00000216420 SAMD10Q9BYL1 202 aa15.65■□□□□ 0.1
CGRRF1-201ENST00000216420 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CGRRF1-201ENST00000216420 GPR27Q9NS67 375 aa15.65■□□□□ 0.1
CGRRF1-201ENST00000216420 HSPB7Q9UBY9 170 aa15.65■□□□□ 0.1
CGRRF1-201ENST00000216420 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 SYNGR3O43761 229 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 IGKV1-5P01602 117 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 PTGDSP41222 190 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 C1orf61Q13536 156 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 DEFB118Q96PH6 123 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 OR2W1Q9Y3N9 320 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 GFERP55789 205 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 TLE1Q04724 770 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 SPANXN5Q5MJ07 72 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 Q6ZN92 141 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 SMIM15Q7Z3B0 74 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 GCNT2Q8N0V5 402 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 KLHDC1Q8N7A1 406 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 OR5T1Q8NG75 326 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 OR1L6Q8NGR2 347 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 SPOCK3Q9BQ16 436 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 PPIAL4AQ9Y536 164 aa15.64■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 TNFSF11O14788 317 aa15.63■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 KITLGP21583 273 aa15.63■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 BMP5P22003 454 aa15.63■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 FFAR4Q5NUL3 377 aa15.63■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 BAGE3Q86Y29 109 aa15.63■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 BAGE2Q86Y30 109 aa15.63■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 OR5B3Q8NH48 314 aa15.63■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 STARD4Q96DR4 205 aa15.63■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 FAM122AQ96E09 287 aa15.63■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 TXN2Q99757 166 aa15.63■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa15.63■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 RNF114Q9Y508 228 aa15.63■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 TIMP3P35625 211 aa15.63■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 CADM4Q8NFZ8 388 aa15.63■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 PSMF1Q92530 271 aa15.63■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 APH1AQ96BI3 265 aa15.63■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 ZPBPQ9BS86 351 aa15.63■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 IL36BQ9NZH7 164 aa15.63■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 KLRF1Q9NZS2 232 aa15.63■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF253O75346 499 aa15.62■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 CBLN1P23435 193 aa15.62■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 TFF2Q03403 129 aa15.62■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 VWC2Q2TAL6 325 aa15.62■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 SAXO1Q8IYX7 474 aa15.62■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF611Q8N823 705 aa15.62■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF114Q8NC26 417 aa15.62■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 SLC24A4Q8NFF2 622 aa15.62■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 OR2M3Q8NG83 312 aa15.62■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 OR10G8Q8NGN5 311 aa15.62■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 OR51H1Q8NH63 302 aa15.62■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 RAB1CQ92928 201 aa15.62■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 BET1LQ9NYM9 111 aa15.62■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 AQP7O14520 342 aa15.61■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 PLCXD3Q63HM9 321 aa15.61■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 PNKDQ8N490 385 aa15.61■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa15.61■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 OR1F12Q8NHA8 337 aa15.61■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 CFHR5Q9BXR6 569 aa15.61■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa15.61■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa15.61■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa15.61■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 NPIPA2E9PIF3 369 aa15.61■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 CD38P28907 300 aa15.61■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 FGF12P61328 243 aa15.61■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 FBLN7Q53RD9 439 aa15.61■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 OR10J3Q5JRS4 329 aa15.61■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 OR56B2PQ8NGI1 322 aa15.61■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 OR6C1Q96RD1 312 aa15.61■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 PMS2P5A8MQ11 134 aa15.6■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 NDUFB4O95168 129 aa15.6■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 KRTDAPP60985 99 aa15.6■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 ETFRF1Q6IPR1 90 aa15.6■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 KLHDC7BQ96G42 594 aa15.6■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 LRFN3Q9BTN0 628 aa15.6■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 LRRC61Q9BV99 259 aa15.6■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 NRN1Q9NPD7 142 aa15.6■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 SLC35D1Q9NTN3 355 aa15.6■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa15.59■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 TSPOP30536 169 aa15.59■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 LGALS4P56470 323 aa15.59■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 RDH5Q92781 318 aa15.59■□□□□ 0.09
CGRRF1-201ENST00000216420 NPCDR1Q9BY65 106 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms