RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	TGFBR3	Q03167	851 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	BSX	Q3C1V8	233 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SMUG1	Q53HV7	270 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SDK2	Q58EX2	2172 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM205	Q6UW68	189 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OAF	Q86UD1	273 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CADM2	Q8N3J6	435 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR52N1	Q8NH53	320 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PFN4	Q8NHR9	129 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	MED30	Q96HR3	178 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TEAD3	Q99594	435 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	MED18	Q9BUE0	208 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TPK1	Q9H3S4	243 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RERGL	Q9H628	205 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	KLK13	Q9UKR3	277 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	BSN	Q9UPA5	3926 aa		3.87	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A0G2JLM5	398 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	DAPL1	A0PJW8	107 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM183A	A6NL82	134 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF726	A6NNF4	738 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM166B	A8MTA8	275 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	MPTX1	A8MV57	137 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CENPBD1	B2RD01	187 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616		J3QRE1	110 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	BHLHE40	O14503	412 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RAD1	O60671	282 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	MPZL1	O95297	269 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CD3G	P09693	182 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR8U9	P0C7N5	309 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ICAM2	P13598	275 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CEL	P19835	753 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SHC1	P29353	583 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SDC2	P34741	201 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PPIC	P45877	212 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB7A	P51149	207 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	FABP6	P51161	128 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PSPH	P78330	225 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	MXD1	Q05195	221 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CDC20	Q12834	499 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB31	Q13636	194 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC10A1	Q14973	349 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	GUSBP1	Q15486	140 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR7A5	Q15622	319 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC36A2	Q495M3	483 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	COX19	Q49B96	90 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	KLHL12	Q53G59	568 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ACTBL2	Q562R1	376 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	C6orf223	Q8N319	242 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	LFNG	Q8NES3	379 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	BEST4	Q8NFU0	473 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR8U1	Q8NH10	309 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	AP3S1	Q92572	193 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SGTB	Q96EQ0	304 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OCR1	Q9BZK8	76 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CMC2	Q9NRP2	79 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	APC2	O95996	2303 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ITPR1	Q14643	2758 aa		3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A087WUJ7	227 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616		J3QLI3	93 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IDH3B	O43837	385 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	REM1	O75628	298 aa		3.85	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	NDUFB2	O95178	105 aa		3.85	□□□□□ -1.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms