RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636280.1

DNM1-222, Transcript of dynamin 1, human

TSL 5

Gene DNM1, Length 2,462 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNM1-222	ENST00000636280	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		13.3	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	MBD2	Q9UBB5	411 aa		13.3	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	KALRN	O60229	2985 aa		13.3	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	IL15RA	Q13261	267 aa		13.3	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	HFE	Q30201	348 aa		13.3	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		13.3	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	THAP6	Q8TBB0	222 aa		13.3	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	C18orf12	Q96KH6	178 aa		13.3	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	COA4	Q9NYJ1	87 aa		13.3	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		13.3	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		13.3	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280		F8W036	122 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280		K7N7A8	449 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	MGST3	O14880	152 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	TNFSF12	O43508	249 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	IFNA21	P01568	189 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	SELL	P14151	372 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	IL2RG	P31785	369 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	SSTR5	P35346	364 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	UQCC3	Q6UW78	93 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	FAM219A	Q8IW50	185 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	LGI3	Q8N145	548 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	IRF2	P14316	349 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	TFF3	Q07654	80 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	MST1L	Q2TV78	715 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	BEX5	Q5H9J7	111 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	STUM	Q69YW2	141 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	LURAP1	Q96LR2	239 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	RNF126	Q9BV68	326 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	DYSF	O75923	2080 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280		H0YIZ8	118 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	IGLV2-14	P01704	120 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	RAB13	P51153	203 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	DSCAM	O60469	2012 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	ODAM	A1E959	279 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	OR8U9	P0C7N5	309 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	GNMT	Q14749	295 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	SVBP	Q8N300	66 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	OR8U1	Q8NH10	309 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	ARL11	Q969Q4	196 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	SDSL	Q96GA7	329 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	ACACB	O00763	2458 aa		13.27	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	ARID1A	O14497	2285 aa		13.27	□□□□□ -0.28
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM218	A2RU14	115 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	RNF222	A6NCQ9	220 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	UQCRFS1	P47985	274 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	RAB32	Q13637	225 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	EFNB3	Q15768	340 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF561	Q8N587	486 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	RFESD	Q8TAC1	157 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	BIN3	Q9NQY0	253 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	LRRC30	A6NM36	301 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	C15orf65	H3BRN8	121 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	KCNAB3	O43448	404 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	GYPA	P02724	150 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	SLC35G3	Q8N808	338 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	RAB19	A4D1S5	217 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	OR2F2	O95006	317 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	F2R	P25116	425 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	S100G	P29377	79 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	EDDM3B	P56851	147 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	SRPX	P78539	464 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	OR2F1	Q13607	317 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF345	Q14585	488 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM56	Q96MV1	263 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DNM1-222	ENST00000636280	GAFA1	Q96PS6	74 aa		13.26	□□□□□ -0.29

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