RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 CCL3L1P16619 93 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 C11orf88Q6PI97 169 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM216AQ8WUB2 273 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 EDARADDQ8WWZ3 215 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 SHPKQ9UHJ6 478 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 MMP23AO75900 390 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 RGS11O94810 467 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 PDLIM4P50479 330 aa20.49■□□□□ 0.87
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CAPNS1-215ENST00000628018 HEPN1Q6WQI6 88 aa20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D26Q86UD7 250 aa20.49■□□□□ 0.87
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CAPNS1-215ENST00000628018 AGMATQ9BSE5 352 aa20.49■□□□□ 0.87
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CAPNS1-215ENST00000628018 SLC22A5O76082 557 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
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CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD55Q3KP44 614 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 LIN54Q6MZP7 749 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF645Q8N7E2 425 aa20.48■□□□□ 0.87
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CAPNS1-215ENST00000628018 COQ8AQ8NI60 647 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2D2Q9H210 308 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 PRR13Q9NZ81 148 aa20.48■□□□□ 0.87
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CAPNS1-215ENST00000628018 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 GOSR2O14653 212 aa20.47■□□□□ 0.87
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CAPNS1-215ENST00000628018 PSG11Q9UQ72 335 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 ST8SIA5O15466 376 aa20.46■□□□□ 0.87
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CAPNS1-215ENST00000628018 ATP5J2P56134 94 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 ERVFRD-1P60508 538 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 GNB2P62879 340 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 SP6Q3SY56 376 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF439Q8NDP4 499 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFSF12O43508 249 aa20.45■□□□□ 0.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 H2BFSP57053 126 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 LY6G5BQ8NDX9 201 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 GLYATL2Q8WU03 294 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 C5orf30Q96GV9 206 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2A7Q96R45 310 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 TP53RKQ96S44 253 aa20.45■□□□□ 0.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 LEAP2Q969E1 77 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 PIPOXQ9P0Z9 390 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC31A2O15432 143 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 SIX6O95475 246 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 PPIAL4GP0DN37 164 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 F2RP25116 425 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 CT45A1Q5HYN5 189 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 DCAF12L2Q5VW00 463 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 CT45A3Q8NHU0 189 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-215ENST00000628018 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa20.43■□□□□ 0.86
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