RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916	UTF1	Q5T230	341 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	PRR18	Q8N4B5	295 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	RFESD	Q8TAC1	157 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	MITD1	Q8WV92	249 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	ARL11	Q969Q4	196 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	GALM	Q96C23	342 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	OR2A7	Q96R45	310 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	RDH8	Q9NYR8	311 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	PRR13	Q9NZ81	148 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	HIVEP2	P31629	2446 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916		A0A0B4J2A0	478 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	FAM172BP	A6NC97	362 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	SMLR1	H3BR10	107 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	DVL1	O14640	695 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	NDUFA2	O43678	99 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	MMP23A	O75900	390 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	SIX6	O95475	246 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	NDUFB7	P17568	137 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	HLA-G	P17693	338 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	VAMP1	P23763	118 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	IL2RG	P31785	369 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	CEACAM6	P40199	344 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	DLX6	P56179	175 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	H2BFS	P57053	126 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	HTD2	P86397	168 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF273	Q14593	569 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM187	Q14656	261 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	AVPI1	Q5T686	147 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	LIN54	Q6MZP7	749 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	GALNT14	Q96FL9	552 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	C5orf30	Q96GV9	206 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	GPHA2	Q96T91	129 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	NAA60	Q9H7X0	242 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	CHODL	Q9H9P2	273 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	CALY	Q9NYX4	217 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	CR1	P17927	2039 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	TNC	P24821	2201 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	INAFM1	C9JVW0	142 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	GPR31	O00270	319 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	HSD17B6	O14756	317 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	MPPED1	O15442	326 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	SPINT2	O43291	252 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	HSPA12A	O43301	675 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	NDUFB3	O43676	98 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	SLC22A5	O76082	557 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	WNT2	P09544	360 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	OR8U9	P0C7N5	309 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	ANXA3	P12429	323 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	OMG	P23515	440 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	CD34	P28906	385 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	EFNA4	P52798	201 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	ERVFRD-1	P60508	538 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	KCNJ8	Q15842	424 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	MORN2	Q502X0	79 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916		Q5BKY6	102 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		6.03	□□□□□ -1.44

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