RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF721	Q8TF20	911 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	TLCD1	Q96CP7	247 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	PYURF	Q96I23	114 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	TRIB3	Q96RU7	358 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	MED18	Q9BUE0	208 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608		R4GN34	69 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	SEC16A	O15027	2179 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	CRB1	P82279	1406 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	LECT2	O14960	151 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	AHSA1	O95433	338 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	OR12D1	P0DN82	309 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF708	P17019	499 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	TCL1A	P56279	114 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	CXCR4	P61073	352 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	HERVK_113	P63121	156 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC35A2	P78381	396 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	NATD1	Q8N6N6	113 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	MED28	Q9H204	178 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	OR51B6	Q9H340	312 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A1W2PP64	1363 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	COPE	O14579	308 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	SH2D1A	O60880	128 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	IGHV3-53	P01767	116 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	CALB1	P05937	261 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	OR4A8	P0C604	315 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	OR1E2	P47887	323 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	PDK2	Q15119	407 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	RSU1	Q15404	277 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	PRR9	Q5T870	116 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF567	Q8N184	647 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	TMBIM1	Q969X1	311 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	OR7D2	Q96RA2	312 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	C3orf18	Q9UK00	162 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	DKKL1	Q9UK85	242 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	ABCC11	Q96J66	1382 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	EVC2	Q86UK5	1308 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608		H3BSA7	217 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	CRYBA1	P05813	215 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	DAP	P51397	102 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	FOXA1	P55317	472 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	GNA13	Q14344	377 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	C1orf195	Q5TG92	126 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	C8orf74	Q6P047	294 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	SCX	Q7RTU7	201 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	OR51H1	Q8NH63	302 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	C8orf76	Q96K31	380 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	UCK1	Q9HA47	277 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	NPAT	Q14207	1427 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	VGLL3	A8MV65	326 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	C15orf65	H3BRN8	121 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC25A20	O43772	301 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	STK16	O75716	305 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	ISG15	P05161	165 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	CDK2	P24941	298 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	DHRS2	Q13268	280 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	BIK	Q13323	160 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	OR8G1	Q15617	311 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF141	Q15928	474 aa		2.66	□□□□□ -1.98

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