RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588477.5

IFT20-216, Transcript of intraflagellar transport 20, human

TSL 5 BASIC

Gene IFT20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT20-216	ENST00000588477	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	RNF150	Q9ULK6	438 aa		11.66	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	RRH	O14718	337 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	SLC25A17	O43808	307 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	RGS11	O94810	467 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	GTF2F2	P13984	249 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	CD40LG	P29965	261 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	OR3A3	P47888	321 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	LFNG	Q8NES3	379 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	LGALS12	Q96DT0	336 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	AASS	Q9UDR5	926 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	GAB2	Q9UQC2	676 aa		11.65	□□□□□ -0.54
IFT20-216	ENST00000588477	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	TRGV3	P03979	118 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	CD2	P06729	351 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	RAB12	Q6IQ22	244 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	RDH12	Q96NR8	316 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	CLCC1	Q96S66	551 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		11.64	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	ZP3	P21754	424 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	BDKRB2	P30411	391 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	PPP3R1	P63098	170 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	GAPT	Q8N292	157 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	TMEM106A	Q96A25	262 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	ORAI1	Q96D31	301 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	JPT1	Q9UK76	154 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		11.63	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	SHISA3	A0PJX4	238 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	UBE2QL1	A1L167	161 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	SNTN	A6NMZ2	147 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	YPEL1	O60688	119 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	LY6G6C	O95867	125 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	TFAP2A	P05549	437 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	RNLS	Q5VYX0	342 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	LCN12	Q6JVE5	192 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	GPR148	Q8TDV2	347 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	CYYR1	Q96J86	154 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	YPEL2	Q96QA6	119 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	AP4S1	Q9Y587	144 aa		11.62	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	ATP8B1	O43520	1251 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	MAS1	P04201	325 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	SYNJ2BP	P57105	145 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	HTD2	P86397	168 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	GPR176	Q14439	515 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		11.61	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477		H7C2Y5	167 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	CA11	O75493	328 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	SC5D	O75845	299 aa		11.6	□□□□□ -0.55
IFT20-216	ENST00000588477	BRI3	O95415	125 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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