RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 OR4K15Q8NH41 348 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 UBALD1Q8TB05 177 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FAM46BQ96A09 425 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 UQCC2Q9BRT2 126 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CST11Q9H112 138 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 IFT22Q9H7X7 185 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF702PQ9H963 129 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 GHRLQ9UBU3 117 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 PSG11Q9UQ72 335 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PPE3 182 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 BET1O15155 118 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 PLA2G10O15496 165 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 SPINT2O43291 252 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 ORC5O43913 435 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 TSPAN15O95858 294 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 LPLP06858 475 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FUT3P21217 361 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 RAB7AP51149 207 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 DEFA6Q01524 100 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 PAX5Q02548 391 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 MOB3BQ86TA1 216 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 LYG1Q8N1E2 194 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM104Q8NE00 496 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 RAB9BQ9NP90 201 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 GNG12Q9UBI6 72 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 SSR3Q9UNL2 185 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FABP12A6NFH5 140 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 LY6LH3BQJ8 138 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 C15orf65H3BRN8 121 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FBXO24O75426 580 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 ARL6IP5O75915 188 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 OR2F2O95006 317 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 UBBP0CG47 229 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CD28P10747 220 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 IL3RAP26951 378 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 HTR2CP28335 458 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 HTR2BP41595 481 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 REG1BP48304 166 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 HNF4GQ14541 408 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 TRAM1Q15629 374 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 OR10K2Q6IF99 312 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 Q6ZS46 218 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 Q8N2B8 174 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 DRAM1Q8N682 238 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 OR56B4Q8NH76 319 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 PHYHIPQ92561 330 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 SNAPC3Q92966 411 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 HYLS1Q96M11 299 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 Q96M66 194 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 NOTCH1P46531 2555 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 M0QZK8 103 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 HSD17B6O14756 317 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 PDCD6O75340 191 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms