RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560521.5

RABGGTA-217, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-217ENST00000560521 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 LPCAT4Q643R3 524 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 C12orf73Q69YU5 71 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 LAX1Q8IWV1 398 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 DHDHQ9UQ10 334 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 PKD1P98161 4303 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTA-217ENST00000560521 ZAR1LA6NP61 321 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 CDRT1O95170 752 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 HTR1AP08908 422 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 MED14OSP0DP75 135 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 RBM11P57052 281 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 TNFRSF9Q07011 255 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 GNMTQ14749 295 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 PLGLAQ15195 96 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 TATDN3Q17R31 274 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 PRR18Q8N4B5 295 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 OR5T1Q8NG75 326 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 OR4K15Q8NH41 348 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 NSL1Q96IY1 281 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 CLCC1Q96S66 551 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 GPER1Q99527 375 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 A0A0G2JLM5 398 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 A0A1B0GVY2 172 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 MAGEB3O15480 346 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 CA2P00918 260 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 ATP6V1E1P36543 226 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 DEFA5Q01523 94 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF529Q6P280 563 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 LYG2Q86SG7 212 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 POC5Q8NA72 575 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 OR52N1Q8NH53 320 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 NEK7Q8TDX7 302 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 CYYR1Q96J86 154 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM192AQ9GZU8 254 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 ING4Q9UNL4 249 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 A0A1W2PP11 408 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 B2RBV5 119 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 H3BUA1 57 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 J3QRE1 110 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 OR2A4O95047 310 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 CT45A6P0DMU7 189 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 CT45A5P0DMU8 189 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 CT45A7P0DMV0 189 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 EDN2P20800 178 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 SERPINA2P20848 420 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 RPEL1Q2QD12 228 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 MPV17LQ2QL34 196 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 C6orf183Q5T699 404 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 LINC00596Q86U02 117 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 GAPTQ8N292 157 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 ASB9Q96DX5 294 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 NRBF2Q96F24 287 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 PELI1Q96FA3 418 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 METTL9Q9H1A3 318 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 RAB9BQ9NP90 201 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 IL36GQ9NZH8 169 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 PEMTQ9UBM1 199 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTA-217ENST00000560521 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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