RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560185.1

AKAP13-215, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 2

Gene AKAP13, Length 611 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-215	ENST00000560185	PEX14	O75381	377 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	SCT	P09683	121 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	REG1B	P48304	166 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF134	P52741	427 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	NCS1	P62166	190 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	RELB	Q01201	579 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	HACD4	Q5VWC8	232 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	DRAM1	Q8N682	238 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	LINC01006	Q8NI28	216 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	CYYR1	Q96J86	154 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF747	Q9BV97	191 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	C16orf95	Q9H693	158 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185		M0QZK8	103 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	FCGR3A	P08637	254 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	OR56B4	Q8NH76	319 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	S1PR3	Q99500	378 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	RAB29	O14966	203 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	SLC31A2	O15432	143 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	FABP7	O15540	132 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	TFAP2A	P05549	437 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	TMEM11	P17152	192 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	DTYMK	P23919	212 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	HNF4G	Q14541	408 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	GNMT	Q14749	295 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	MZT2A	Q6P582	158 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	C11orf88	Q6PI97	169 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	AP3S1	Q92572	193 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	SCOC	Q9UIL1	159 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	BET1	O15155	118 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	CHST1	O43916	411 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	OR2F2	O95006	317 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	CTXN2	P0C2S0	81 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	GSTT2	P0CG29	244 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	GSTT2B	P0CG30	244 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	ALDH3B2	P48448	385 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	GINS4	Q9BRT9	223 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	ABCG5	Q9H222	651 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF221	Q9UK13	617 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185	COL6A5	A8TX70	2615 aa		12.77	□□□□□ -0.36
AKAP13-215	ENST00000560185		A0A1W2PPI3	338 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP13-215	ENST00000560185	TMEM235	A6NFC5	223 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP13-215	ENST00000560185	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP13-215	ENST00000560185	ITGB1BP1	O14713	200 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP13-215	ENST00000560185	LANCL1	O43813	399 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP13-215	ENST00000560185	GABARAP	O95166	117 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP13-215	ENST00000560185	IGKV1D-33	P01593	117 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP13-215	ENST00000560185	IGKV1-33	P01594	117 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP13-215	ENST00000560185	CD1B	P29016	333 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP13-215	ENST00000560185	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
AKAP13-215	ENST00000560185	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP13-215	ENST00000560185	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AKAP13-215	ENST00000560185	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		12.76	□□□□□ -0.37
AKAP13-215	ENST00000560185	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
AKAP13-215	ENST00000560185	ST8SIA5	O15466	376 aa		12.76	□□□□□ -0.37
AKAP13-215	ENST00000560185	XRCC3	O43542	346 aa		12.76	□□□□□ -0.37
AKAP13-215	ENST00000560185	DIRAS3	O95661	229 aa		12.76	□□□□□ -0.37
AKAP13-215	ENST00000560185	MOS	P00540	346 aa		12.76	□□□□□ -0.37
AKAP13-215	ENST00000560185	SOX6	P35712	828 aa		12.76	□□□□□ -0.37
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF137P	P52743	207 aa		12.76	□□□□□ -0.37
AKAP13-215	ENST00000560185	BLCAP	P62952	87 aa		12.76	□□□□□ -0.37
AKAP13-215	ENST00000560185	CTF1	Q16619	201 aa		12.76	□□□□□ -0.37

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