RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554340.1

NEMP1-204, Transcript of nuclear envelope integral membrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEMP1, Length 1,381 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP1-204ENST00000554340 FAM27D1Q5T7N8 215 aa16.08■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 OR52L2PQ8NGH6 319 aa16.08■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 OR6M1Q8NGM8 313 aa16.08■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 DUX3Q96PT4 197 aa16.08■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 FAAP24Q9BTP7 215 aa16.08■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 VCX3BQ9H321 246 aa16.08■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 PLSCR3Q9NRY6 295 aa16.08■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa16.08■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 CCL24O00175 119 aa16.07■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 ARL6IP5O75915 188 aa16.07■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 UCHL1P09936 223 aa16.07■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 OR5H8P0DN80 308 aa16.07■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 VDAC1P21796 283 aa16.07■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 OR2AK2Q8NG84 335 aa16.07■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa16.07■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 TM2D1Q9BX74 207 aa16.07■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 SLC22A1O15245 554 aa16.06■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 RGS10O43665 173 aa16.06■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 ELANEP08246 267 aa16.06■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 HSMCR30P0CW71 290 aa16.06■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 LSAMPQ13449 338 aa16.06■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 FOXE3Q13461 319 aa16.06■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 LIPKQ5VXJ0 399 aa16.06■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 MOB1BQ7L9L4 216 aa16.06■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 RNF152Q8N8N0 203 aa16.06■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 OR8U1Q8NH10 309 aa16.06■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa16.06■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 SULT4A1Q9BR01 284 aa16.06■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 PLGRKTQ9HBL7 147 aa16.06■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 ISYNA1Q9NPH2 558 aa16.06■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 F2RL1P55085 397 aa16.05■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 AQP4P55087 323 aa16.05■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 RAB25P57735 213 aa16.05■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 IRF3Q14653 427 aa16.05■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 MMDQ15546 238 aa16.05■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 OR10K2Q6IF99 312 aa16.05■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 C6orf201Q7Z4U5 140 aa16.05■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa16.05■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 IL1F10Q8WWZ1 152 aa16.05■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 TMEM203Q969S6 136 aa16.05■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 ZNF251Q9BRH9 671 aa16.05■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 MGAT4AQ9UM21 535 aa16.05■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 RAMP3O60896 148 aa16.04■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 CD37P11049 281 aa16.04■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 ARSBP15848 533 aa16.04■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 TPBGQ13641 420 aa16.04■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 GNMTQ14749 295 aa16.04■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 KIR2DS1Q14954 304 aa16.04■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 HMGN3Q15651 99 aa16.04■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 DEFB136Q30KP8 78 aa16.04■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 LCNL1Q6ZST4 164 aa16.04■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 SETD6Q8TBK2 473 aa16.04■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 CCDC90BQ9GZT6 254 aa16.04■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 GHITMQ9H3K2 345 aa16.04■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 DUSP21Q9H596 190 aa16.04■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 PIPOXQ9P0Z9 390 aa16.04■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 ZNF580Q9UK33 172 aa16.04■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 TMEM14DPA8MWL7 114 aa16.03■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 IGF1P05019 195 aa16.03■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 MYF6P23409 242 aa16.03■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 PSMD7P51665 324 aa16.03■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 CFHR3Q02985 330 aa16.03■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 OR5M8Q8NGP6 311 aa16.03■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 KIAA1456Q9P272 454 aa16.03■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 ERICH4A6NGS2 130 aa16.02■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 SLC17A2O00624 439 aa16.02■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 RAB29O14966 203 aa16.02■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 IGHG4P01861 327 aa16.02■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 HSPA13P48723 471 aa16.02■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 LUMP51884 338 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 ACTBP60709 375 aa16.02■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 UNC119Q13432 240 aa16.02■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 FAM71F2Q6NXP2 309 aa16.02■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 TMEM65Q6PI78 240 aa16.02■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa16.02■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 SVOPQ8N4V2 548 aa16.02■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 NABP2Q9BQ15 211 aa16.02■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 HSPB9Q9BQS6 159 aa16.02■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 ANKRD60Q9BZ19 345 aa16.02■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 RYR3Q15413 4870 aa16.02■□□□□ 0.16
NEMP1-204ENST00000554340 NAPSAO96009 420 aa16.01■□□□□ 0.15
NEMP1-204ENST00000554340 QRFPP83859 136 aa16.01■□□□□ 0.15
NEMP1-204ENST00000554340 RAB11BQ15907 218 aa16.01■□□□□ 0.15
NEMP1-204ENST00000554340 C9orf66Q5T8R8 295 aa16.01■□□□□ 0.15
NEMP1-204ENST00000554340 PRSS48Q7RTY5 328 aa16.01■□□□□ 0.15
NEMP1-204ENST00000554340 ODF3L1Q8IXM7 274 aa16.01■□□□□ 0.15
NEMP1-204ENST00000554340 NRG4Q8WWG1 115 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms