RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553570.5

ATXN3-222, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 757 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-222	ENST00000553570	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	NEURL2	Q9BR09	285 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	PPA2	Q9H2U2	334 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	BANF2	Q9H503	90 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	OPN4	Q9UHM6	478 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	MEIOC	A2RUB1	952 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	FUOM	A2VDF0	154 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	C15orf62	A8K5M9	175 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570		A8MXK9	166 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570		K7N7A8	449 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	GABRP	O00591	440 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	GPR137B	O60478	399 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	FCN3	O75636	299 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	VENTX	O95231	258 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	FSTL3	O95633	263 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	OR2H2	O95918	312 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	IGKV1D-12	P01611	117 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	IGHV1-69	P01742	117 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	ALDOB	P05062	364 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	CCL3L1	P16619	93 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	SRM	P19623	302 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	NFYB	P25208	207 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	PSMB9	P28065	219 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	CAV3	P56539	151 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	ACTG1	P63261	375 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	SLC35A2	P78381	396 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	VWC2	Q2TAL6	325 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	PIGY	Q3MUY2	71 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570		Q6ZSR3	168 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	OSR2	Q8N2R0	312 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	SETD6	Q8TBK2	473 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	FAM46B	Q96A09	425 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	SDSL	Q96GA7	329 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	TBX15	Q96SF7	602 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	MGLL	Q99685	303 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	DUSP21	Q9H596	190 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	HMG20A	Q9NP66	347 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	LRRC42	Q9Y546	428 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	hADV38S2	A0JD32	116 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	SMIM30	A4D0T7	59 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	FAM172BP	A6NC97	362 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	BTBD17	A6NE02	478 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	TOR1A	O14656	332 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	NPFF	O15130	113 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	IGHV3-7	P01780	117 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	ARG1	P05089	322 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	TFAP2A	P05549	437 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF728	P0DKX0	622 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	GTF2F2	P13984	249 aa		3.79	□□□□□ -1.8

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