RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 CIB1Q99828 191 aa5.07□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 NEURL2Q9BR09 285 aa5.07□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 IFI27L2Q9H2X8 130 aa5.07□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 ING4Q9UNL4 249 aa5.07□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 UBE2QL1A1L167 161 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 MSGN1A6NI15 193 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 AIPO00170 330 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 BMPR1BO00238 502 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 RRHO14718 337 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC16A6O15403 523 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 ORC5O43913 435 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 S1PR2O95136 353 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 CA2P00918 260 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 IGKV1-16P04430 117 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 OR5H8P0DN80 308 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 GZMHP20718 246 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 SERPINA2P20848 420 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 RIPK1Q13546 671 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 PSG5Q15238 335 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 RSU1Q15404 277 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 ACTBL2Q562R1 376 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 XP32Q5T750 250 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 AMIGO2Q86SJ2 522 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 GAPTQ8N292 157 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 PARP16Q8N5Y8 322 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 OR52N1Q8NH53 320 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM106AQ96A25 262 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 ASB9Q96DX5 294 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 C5orf30Q96GV9 206 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 ABHD14BQ96IU4 210 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM192AQ9GZU8 254 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 GHITMQ9H3K2 345 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 KCNK15Q9H427 330 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 BANF2Q9H503 90 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 IFT22Q9H7X7 185 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF556Q9HAH1 456 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 TAF9BQ9HBM6 251 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM118AQ9NWS6 357 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 GNG12Q9UBI6 72 aa5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 SHISA3A0PJX4 238 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 OR11H12B2RN74 326 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 H0YJW9 148 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC25A17O43808 307 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 BAG2O95816 211 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 FADS2O95864 444 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 LALBAP00709 142 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 IGLV2-23P01705 113 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 HTR1AP08908 422 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 DBTP11182 482 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 CCR9P51686 369 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 ACTR3P61158 418 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF45Q02386 682 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 DEFB114Q30KQ6 69 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 SPATS1Q496A3 300 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 GID4Q8IVV7 300 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 GRPEL2Q8TAA5 225 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 ABHD5Q8WTS1 349 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 LGALS12Q96DT0 336 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 THTPAQ9BU02 230 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 ELOVL1Q9BW60 279 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 AMBNQ9NP70 447 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 OR2S2Q9NQN1 319 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 KRT84Q9NSB2 600 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 ETAA1Q9NY74 926 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 S4R3C0 116 aa5.05□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 A0A1W2PPK0 400 aa5.04□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 AQP12BA6NM10 295 aa5.04□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 PPP5D1E7EU14 171 aa5.04□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 H3BNX3 289 aa5.04□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 IL3RAP26951 378 aa5.04□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC22A6Q4U2R8 563 aa5.04□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 AKIRIN2Q53H80 203 aa5.04□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 NHLRC3Q5JS37 347 aa5.04□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 C6orf141Q5SZD1 244 aa5.04□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 RAB12Q6IQ22 244 aa5.04□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF343Q6P1L6 599 aa5.04□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 LYG2Q86SG7 212 aa5.04□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 SPATA24Q86W54 205 aa5.04□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 AQP12AQ8IXF9 295 aa5.04□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF383Q8NA42 475 aa5.04□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 CCDC54Q8NEL0 328 aa5.04□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 NEK7Q8TDX7 302 aa5.04□□□□□ -1.6
CTDSP2-208ENST00000552294 NSL1Q96IY1 281 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms