RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 PSG5Q15238 335 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 HELTA6NFD8 242 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 MGAT2Q10469 447 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 FADS6Q8N9I5 356 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC25A22Q9H936 323 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 COL4A1P02462 1669 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 PSG2P11465 335 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 SULT1A2P50226 295 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 MAS1LP35410 378 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 ELOBQ15370 118 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 Q1RN00 199 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 GYPAP02724 150 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRB-208ENST00000550358 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRB-208ENST00000550358 NHLH1Q02575 133 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRB-208ENST00000550358 NHLH2Q02577 135 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRB-208ENST00000550358 OTPQ5XKR4 325 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRB-208ENST00000550358 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRB-208ENST00000550358 MRGPRFQ96AM1 343 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRB-208ENST00000550358 TREM2Q9NZC2 230 aa7.33□□□□□ -1.24
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