RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547256.1

LETMD1-208, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 2

Gene LETMD1, Length 618 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-208	ENST00000547256	GNGT1	P63211	74 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256	ROM1	Q03395	351 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256	RIPK1	Q13546	671 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256	COQ5	Q5HYK3	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256		Q6ZRM9	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256		Q6ZSR3	168 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256	LINC00596	Q86U02	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256	OR11H2	Q8NH07	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256	CCDC107	Q8WV48	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256	JAM3	Q9BX67	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256		R4GMQ9	66 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256		X6R8D5	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LETMD1-208	ENST00000547256	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256		H3BUA1	57 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	LGALS9	O00182	355 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	NME4	O00746	187 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	APOL3	O95236	402 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	CA2	P00918	260 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	ATF1	P18846	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	PRKACB	P22694	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	CBLN1	P23435	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	OR3A3	P47888	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	FXYD3	Q14802	87 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	MICA	Q29983	383 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256		Q3ZCU0	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	GLYAT	Q6IB77	296 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	CPO	Q8IVL8	374 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	THRSP	Q92748	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	MLX	Q9UH92	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256		H3BN98	237 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	TNFRSF11B	O00300	401 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	CCNB2	O95067	398 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256		Q5VSD8	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256		Q6ZTC4	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	SVOP	Q8N4V2	548 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	OR5B3	Q8NH48	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	OR4A5	Q8NH83	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	PP6455	Q8WZ26	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	PYURF	Q96I23	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	OPALIN	Q96PE5	141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	RNF126	Q9BV68	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	COA4	Q9NYJ1	87 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	ING4	Q9UNL4	249 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256		A0A0G2JND7	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	PPP5D1	E7EU14	171 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	ORC5	O43913	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	TUSC2	O75896	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	OR2C1	O95371	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	FAM107A	O95990	144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	IFNA21	P01568	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LETMD1-208	ENST00000547256	IFNA17	P01571	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.7 ms