RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7A-216ENST00000543170 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.77□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 TRDCB7Z8K6 153 aa14.77□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 ITGB1BP1O14713 200 aa14.77□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 LPLP06858 475 aa14.77□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 RAB13P51153 203 aa14.77□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF134P52741 427 aa14.77□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 ARFRP1Q13795 201 aa14.77□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 CDNFQ49AH0 187 aa14.77□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 UBE2NLQ5JXB2 153 aa14.77□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 C5orf24Q7Z6I8 188 aa14.77□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 THNSL2Q86YJ6 484 aa14.77□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.77□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.77□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 C16orf95Q9H693 158 aa14.77□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 CHST1O43916 411 aa14.76□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 SCTP09683 121 aa14.76□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 ZBTB25P24278 435 aa14.76□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 TALDO1P37837 337 aa14.76□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa14.76□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 Q6ZSV7 163 aa14.76□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 DTX3Q8N9I9 347 aa14.76□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 OR2AK2Q8NG84 335 aa14.76□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 RAB2BQ8WUD1 216 aa14.76□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 ACOT12Q8WYK0 555 aa14.76□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 CFHR4Q92496 578 aa14.76□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 CMTM3Q96MX0 182 aa14.76□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa14.76□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 TOLLIPQ9H0E2 274 aa14.76□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 DCSTAMPQ9H295 470 aa14.76□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 BEX1Q9HBH7 125 aa14.76□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 DIABLOQ9NR28 239 aa14.76□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM235A6NFC5 223 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 TIMM23O14925 209 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 FABP7O15540 132 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 MDKP21741 143 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 RORCP51449 518 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 FAM71F2Q6NXP2 309 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 AKR1E2Q96JD6 320 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 GHITMQ9H3K2 345 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 SCOCQ9UIL1 159 aa14.75□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 CLPSL1A2RUU4 121 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 LANCL1O43813 399 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 FAM106CPP0CH98 169 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 TMBIM6P55061 237 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 GNG2P59768 71 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 HERPUD1Q15011 391 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM219Q86XT9 240 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 ODF3L1Q8IXM7 274 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 IZUMO1Q8IYV9 350 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 LYG1Q8N1E2 194 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 OR4C13Q8NGP0 309 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 OR56B4Q8NH76 319 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 AP3S1Q92572 193 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 IFI27L2Q9H2X8 130 aa14.74□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 HSPA12AO43301 675 aa14.73□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 XRCC3O43542 346 aa14.73□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 OR2F2O95006 317 aa14.73□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.73□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 DRAM1Q8N682 238 aa14.73□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 SAMD12Q8N8I0 201 aa14.73□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 LINC01006Q8NI28 216 aa14.73□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa14.73□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.73□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 OR1A1Q9P1Q5 309 aa14.73□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 TENM1Q9UKZ4 2725 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 TRAV18A0A075B6X5 111 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 REG1BP48304 166 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 EBI3Q14213 229 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 Q8N2B8 174 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 AGMATQ9BSE5 352 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF747Q9BV97 191 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 AUNIPQ9H7T9 357 aa14.72□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 M0QZK8 103 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 RAB29O14966 203 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 SSX5O60225 188 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 APOA1P02647 267 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 GSTT2P0CG29 244 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 GSTT2BP0CG30 244 aa14.71□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
COPS7A-216ENST00000543170 CD24P25063 80 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms