RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		12.51	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM65	Q6PI78	240 aa		12.51	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		12.51	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		12.51	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		12.51	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	CYYR1	Q96J86	154 aa		12.51	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	ASCL2	Q99929	193 aa		12.51	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	KLK15	Q9H2R5	256 aa		12.51	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		12.51	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777		G3V318	75 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	CNTFR	P26992	372 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	MAP2K4	P45985	399 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	ACTB	P60709	375 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	GNMT	Q14749	295 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	RITA1	Q96K30	269 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777		Q96M66	194 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	NABP2	Q9BQ15	211 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	OR51J1	Q9H342	316 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	GNB4	Q9HAV0	340 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	SCN3B	Q9NY72	215 aa		12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777		I3L521	148 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	ATP6V0E1	O15342	81 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	PDCD6	O75340	191 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	OR8U8	P0C7N1	319 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	INSL3	P51460	131 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	TAS2R43	P59537	309 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	LYPD6	Q86Y78	171 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	DERL3	Q96Q80	235 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	OR5B12	Q96R08	314 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	PARP11	Q9NR21	331 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	JPT1	Q9UK76	154 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	VSIG4	Q9Y279	399 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	LRRC42	Q9Y546	428 aa		12.49	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		12.48	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	NBR2	O15453	112 aa		12.48	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	YPEL1	O60688	119 aa		12.48	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	LY86	O95711	162 aa		12.48	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	IGLV1-40	P01703	118 aa		12.48	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	HLA-DRB1	P01911	266 aa		12.48	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	HTD2	P86397	168 aa		12.48	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	RUNX1	Q01196	453 aa		12.48	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF616	Q08AN1	781 aa		12.48	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		12.48	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	FAM46B	Q96A09	425 aa		12.48	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	YPEL2	Q96QA6	119 aa		12.48	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777		Q9H521	79 aa		12.48	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		12.47	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	RGS10	O43665	173 aa		12.47	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	RGS11	O94810	467 aa		12.47	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	CEL	P19835	753 aa		12.47	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	OR3A3	P47888	321 aa		12.47	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	RAB9A	P51151	201 aa		12.47	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	GNB1	P62873	340 aa		12.47	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		12.47	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		12.47	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	LIN54	Q6MZP7	749 aa		12.47	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		12.47	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		12.47	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	GALM	Q96C23	342 aa		12.47	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		12.47	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	KIAA1456	Q9P272	454 aa		12.47	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	GHRL	Q9UBU3	117 aa		12.47	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	MYL12B	O14950	172 aa		12.46	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	CD1A	P06126	327 aa		12.46	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	CHAT	P28329	748 aa		12.46	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	WNT4	P56705	351 aa		12.46	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	RNLS	Q5VYX0	342 aa		12.46	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		12.46	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	NPB	Q8NG41	125 aa		12.46	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		12.46	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	DCUN1D4	Q92564	292 aa		12.46	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		12.46	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		12.46	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	CST11	Q9H112	138 aa		12.46	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		12.46	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		12.46	□□□□□ -0.41
DDX11-222	ENST00000542777	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		12.45	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	OVOL1	O14753	267 aa		12.45	□□□□□ -0.42
DDX11-222	ENST00000542777	NDUFA3	O95167	84 aa		12.45	□□□□□ -0.42

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