RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MFNGO00587 321 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ITGB1BP1O14713 200 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGKV1D-33P01593 117 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGKV1-33P01594 117 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 VSIG10L2P0DP72 767 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM11P17152 192 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 REG1BP48304 166 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCAND1P57086 179 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HES1Q14469 280 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARL6IP1Q15041 203 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C2orf68Q2NKX9 166 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ABCA11PQ4W5N1 156 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM71F2Q6NXP2 309 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SFXN4Q6P4A7 337 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TREML4Q6UXN2 200 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 Q6ZS46 218 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MOB3BQ86TA1 216 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 Q8N6K4 173 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR2AK2Q8NG84 335 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SETD6Q8TBK2 473 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 Q9N2K0 584 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 A0A0B4J203 849 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRIM64CA6NLI5 447 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SERPINE3A8MV23 424 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM127O75204 238 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PEX14O75381 377 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MOGAT2Q3SYC2 334 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C5orf24Q7Z6I8 188 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ODF3L1Q8IXM7 274 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LYG1Q8N1E2 194 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C5orf56Q8N8D9 126 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR2T10Q8NGZ9 312 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IL1F10Q8WWZ1 152 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KCNK7Q9Y2U2 307 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CMYA5Q8N3K9 4069 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SMIM30A4D0T7 59 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCGNO76038 276 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CD3GP09693 182 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZBTB25P24278 435 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SDC2P34741 201 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EDARADDQ8WWZ3 215 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CENPOQ9BU64 300 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IFI27L2Q9H2X8 130 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MMP27Q9H306 513 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GHITMQ9H3K2 345 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PIPOXQ9P0Z9 390 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DAPK2Q9UIK4 370 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RRP9O43818 475 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FBXO24O75426 580 aa12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DIRAS3O95661 229 aa12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MOSP00540 346 aa12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FCGR3AP08637 254 aa12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LSAMPQ13449 338 aa12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM95Q3KNT9 176 aa12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR8H1Q8NGG4 311 aa12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 YIPF6Q96EC8 236 aa12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC23A1Q9UHI7 598 aa12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa12.85□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa12.85□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TRDCB7Z8K6 153 aa12.85□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GNB3P16520 340 aa12.85□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SERPINB10P48595 397 aa12.85□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KIR2DS1Q14954 304 aa12.85□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR4A4PQ8NGN8 299 aa12.85□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LGALS14Q8TCE9 139 aa12.85□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CABLES2Q9BTV7 478 aa12.85□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TOLLIPQ9H0E2 274 aa12.85□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATG5Q9H1Y0 275 aa12.85□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RNF167Q9H6Y7 350 aa12.85□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ETV7Q9Y603 341 aa12.85□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RAB29O14966 203 aa12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCTP09683 121 aa12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MXD1Q05195 221 aa12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 Q6ZS49 121 aa12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CROCCP3Q8IVE0 287 aa12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NABP2Q9BQ15 211 aa12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AGMATQ9BSE5 352 aa12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 OR1A1Q9P1Q5 309 aa12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MGAM2Q2M2H8 2515 aa12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa12.83□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ST8SIA5O15466 376 aa12.83□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FABP7O15540 132 aa12.83□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HSPA12AO43301 675 aa12.83□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AIREO43918 545 aa12.83□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TSPAN15O95858 294 aa12.83□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGHG2P01859 326 aa12.83□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CSF1P09603 554 aa12.83□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CLEC2LP0C7M8 214 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.3 ms