RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 CNBD2Q96M20 576 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 YPEL2Q96QA6 119 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 KCNK15Q9H427 330 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 DUSP21Q9H596 190 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 PLSCR3Q9NRY6 295 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 STEAP1Q9UHE8 339 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 JPT1Q9UK76 154 aa7.11□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 ERICH4A6NGS2 130 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 SLC22A1O15245 554 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 SOCS1O15524 211 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 LANCL1O43813 399 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 ARL6IP5O75915 188 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 CPEP16870 476 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 VDAC1P21796 283 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 CRHBPP24387 322 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 CALRP27797 417 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 MAP2K4P45985 399 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 THBS3P49746 956 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 ZNF137PP52743 207 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 RAB25P57735 213 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 UNC119Q13432 240 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 TPBGQ13641 420 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 MMDQ15546 238 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 TMEM91Q6ZNR0 172 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 PRSS48Q7RTY5 328 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 OR2W3Q7Z3T1 314 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 ZNF695Q8IW36 515 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 MGLLQ99685 303 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 TM2D1Q9BX74 207 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.1□□□□□ -1.27
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LMO3-222ENST00000540445 ISYNA1Q9NPH2 558 aa7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 SLC17A2O00624 439 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 HSPA12AO43301 675 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 SLC6A1P30531 599 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 MYCNOSP40205 109 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 RANBP1P43487 201 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 OR3A3P47888 321 aa7.09□□□□□ -1.27
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LMO3-222ENST00000540445 PSMD7P51665 324 aa7.09□□□□□ -1.27
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LMO3-222ENST00000540445 LSAMPQ13449 338 aa7.09□□□□□ -1.27
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LMO3-222ENST00000540445 DUX3Q96PT4 197 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
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LMO3-222ENST00000540445 V9GY05 133 aa7.09□□□□□ -1.27
LMO3-222ENST00000540445 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 H7C2Y5 167 aa7.08□□□□□ -1.28
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LMO3-222ENST00000540445 RAB29O14966 203 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 ST8SIA5O15466 376 aa7.08□□□□□ -1.28
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LMO3-222ENST00000540445 ZBTB25P24278 435 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
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LMO3-222ENST00000540445 FABP5Q01469 135 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 FOXE3Q13461 319 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 HMGN3Q15651 99 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 LY6G6FQ5SQ64 297 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 HES5Q5TA89 166 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 LIN54Q6MZP7 749 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 TMEM65Q6PI78 240 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.08□□□□□ -1.28
LMO3-222ENST00000540445 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.08□□□□□ -1.28
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