RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516908.1

RNU6-352P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 352, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-352P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-352P-201ENST00000516908 OCM2P0CE71 109 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 SMIM18P0DKX4 95 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 HNF1AP20823 631 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 SERPINA2P20848 420 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 PRTN3P24158 256 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 DCKP27707 260 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 GLP1RP43220 463 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 RBP2P50120 134 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 FUT6P51993 359 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 ATP1B3P54709 279 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 WNT4P56705 351 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 EDDM3BP56851 147 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 RBM11P57052 281 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 RPL31P62899 125 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 ACTG1P63261 375 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF146Q15072 292 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 GRK1Q15835 563 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 MOGAT2Q3SYC2 334 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 SLC22A6Q4U2R8 563 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 HES5Q5TA89 166 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 TTC23Q5W5X9 447 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 AWAT2Q6E213 333 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 TEX38Q6PEX7 206 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 ASCL4Q6XD76 172 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF573Q86YE8 665 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 STX19Q8N4C7 294 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 KIR3DL3Q8N743 410 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 SUMF2Q8NBJ7 301 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF114Q8NC26 417 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 OR4P4Q8NGL7 312 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 OR1L1Q8NH94 360 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 RFESDQ8TAC1 157 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 NANPQ8TBE9 248 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 MRGPRDQ8TDS7 321 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 CCDC107Q8WV48 283 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 TMED6Q8WW62 240 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 PP6455Q8WZ26 134 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 CREB3L1Q96BA8 519 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 SULT4A1Q9BR01 284 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 COMMD4Q9H0A8 199 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 A0A1W2PPI3 338 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 ODAMA1E959 279 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 C12orf77C9JDV5 145 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 C15orf65H3BRN8 121 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 MYL12BO14950 172 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 SOCS1O15524 211 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 KCNAB3O43448 404 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 MPZL2O60487 215 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 GATBO75879 557 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 CLPXO76031 633 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 LIPFP07098 398 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 CD3GP09693 182 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 UCHL1P09936 223 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 CCDC159P0C7I6 412 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 HSMCR30P0CW71 290 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF728P0DKX0 622 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 IGHV1-8P0DP01 117 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 PTHLHP12272 177 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 ZNF44P15621 663 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 MYL12AP19105 171 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 RAB3AP20336 220 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 CDK2P24941 298 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 HTR2CP28335 458 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 PTGFRP43088 359 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 IER3P46695 156 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 REG1BP48304 166 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 GNG10P50151 68 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 UBE2V1Q13404 147 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 MADCAM1Q13477 382 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 RIPK1Q13546 671 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 Q499Y3 187 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 ACSM3Q53FZ2 586 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 KLHL22Q53GT1 634 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 LRRC10Q5BKY1 277 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 BTNL3Q6UXE8 466 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 JAGN1Q8N5M9 183 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 Q8NFD4 153 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 OR10V1Q8NGI7 309 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 OR51T1Q8NGJ9 327 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 OR4K15Q8NH41 348 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-352P-201ENST00000516908 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms