RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496305.5

PHF20-215, Transcript of PHD finger protein 20, human

TSL 4

Gene PHF20, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20-215	ENST00000496305	ORM1	P02763	201 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PHF20-215	ENST00000496305	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
PHF20-215	ENST00000496305	HTR4	Q13639	388 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PHF20-215	ENST00000496305	PDGFRL	Q15198	375 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF567	Q8N184	647 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PHF20-215	ENST00000496305	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PHF20-215	ENST00000496305	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PHF20-215	ENST00000496305	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PHF20-215	ENST00000496305	GPR22	Q99680	433 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PHF20-215	ENST00000496305	PTPRJ	Q12913	1337 aa		2.59	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		2.59	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		2.58	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		2.58	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	DEDD	O75618	318 aa		2.58	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.58	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	ATP6V0C	P27449	155 aa		2.58	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	LPAR6	P43657	344 aa		2.58	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	OR10A6	Q8NH74	314 aa		2.58	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	ERMN	Q8TAM6	284 aa		2.58	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		2.58	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	MGLL	Q99685	303 aa		2.58	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	MND1	Q9BWT6	205 aa		2.58	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	MED28	Q9H204	178 aa		2.58	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		2.58	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		2.58	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	COL18A1	P39060	1754 aa		2.58	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	CCRL2	O00421	344 aa		2.57	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	COPE	O14579	308 aa		2.57	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	OR13C7	P0DN81	318 aa		2.57	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	CD99	P14209	185 aa		2.57	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	GRPR	P30550	384 aa		2.57	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	CRAT	P43155	626 aa		2.57	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	OR1E2	P47887	323 aa		2.57	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	KRTAP12-3	P60328	96 aa		2.57	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	DAD1	P61803	113 aa		2.57	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF117	Q03924	483 aa		2.57	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		2.57	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		2.57	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		2.57	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	CYGB	Q8WWM9	190 aa		2.57	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		2.57	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		2.57	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		2.56	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	GOLGA8R	I6L899	631 aa		2.56	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	ZW10	O43264	779 aa		2.56	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	STX10	O60499	249 aa		2.56	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	SLC25A16	P16260	332 aa		2.56	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	RWDD2B	P57060	319 aa		2.56	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	TLCD1	Q96CP7	247 aa		2.56	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		2.56	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	PIK3R4	Q99570	1358 aa		2.56	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		2.55	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	METTL15	A6NJ78	407 aa		2.55	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	TRAPPC3	O43617	180 aa		2.55	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	YEATS4	O95619	227 aa		2.55	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	CRYBA1	P05813	215 aa		2.55	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		2.55	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	CDK2	P24941	298 aa		2.55	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	PSMB6	P28072	239 aa		2.55	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	H2BFS	P57053	126 aa		2.55	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		2.55	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		2.55	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		2.55	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		2.55	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		2.55	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		2.55	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	OR11H1	Q8NG94	326 aa		2.55	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	ACY3	Q96HD9	319 aa		2.55	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	OR7D2	Q96RA2	312 aa		2.55	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	SNX12	Q9UMY4	172 aa		2.55	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	TMEM94	Q12767	1356 aa		2.54	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	DHRS12	A0PJE2	317 aa		2.54	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	LINC00614	P0C842	121 aa		2.54	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	SKP1	P63208	163 aa		2.54	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		2.54	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		2.54	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	MBOAT7	Q96N66	472 aa		2.54	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	UPK3B	Q9BT76	320 aa		2.54	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		2.54	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	PARVA	Q9NVD7	372 aa		2.54	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		2.54	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305		A0A0J9YX75	114 aa		2.53	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	C17orf51	A8MQB3	221 aa		2.53	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	OPRM1	P35372	400 aa		2.53	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	DMTN	Q08495	405 aa		2.53	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		2.53	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305	RASL11A	Q6T310	242 aa		2.53	□□□□□ -2
PHF20-215	ENST00000496305		Q6ZRU5	148 aa		2.53	□□□□□ -2

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