RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489333.1

GABRE-210, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor epsilon subunit, humanhuman

TSL 2

Gene GABRE, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRE-210ENST00000489333 CDH20Q9HBT6 801 aa7.34□□□□□ -1.23
GABRE-210ENST00000489333 WFDC1Q9HC57 220 aa7.34□□□□□ -1.23
GABRE-210ENST00000489333 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
GABRE-210ENST00000489333 TAAR3PQ9P1P4 343 aa7.34□□□□□ -1.23
GABRE-210ENST00000489333 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
GABRE-210ENST00000489333 WIPI2Q9Y4P8 454 aa7.34□□□□□ -1.23
GABRE-210ENST00000489333 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 IGSF23A1L1A6 192 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 FAM221AA4D161 298 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 PINLYPA6NC86 204 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 IQCF6A8MYZ5 107 aa7.33□□□□□ -1.24
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GABRE-210ENST00000489333 AGPAT2O15120 278 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 TXNL1O43396 289 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 SYNGR2O43760 224 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 SSSCA1O60232 199 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 F10P00742 488 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 SCTP09683 121 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 RAB5AP20339 215 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 MAGEA5P43359 124 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 MEOX1P50221 254 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 PAX5Q02548 391 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 ZNF497Q6ZNH5 498 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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GABRE-210ENST00000489333 C17orf78Q8N4C9 275 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 OR11L1Q8NGX0 322 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 CD300LFQ8TDQ1 290 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 BTF3L4Q96K17 158 aa7.33□□□□□ -1.24
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GABRE-210ENST00000489333 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.33□□□□□ -1.24
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GABRE-210ENST00000489333 NCKAP5O14513 1909 aa7.33□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
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GABRE-210ENST00000489333 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.32□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 IFNL4K9M1U5 179 aa7.32□□□□□ -1.24
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GABRE-210ENST00000489333 HOXC12P31275 282 aa7.32□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 MEOX2P50222 304 aa7.32□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 AKR1D1P51857 326 aa7.32□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 CD81P60033 236 aa7.32□□□□□ -1.24
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GABRE-210ENST00000489333 RPP30P78346 268 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 SRYQ05066 204 aa7.32□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 HERPUD1Q15011 391 aa7.32□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
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GABRE-210ENST00000489333 P4HA3Q7Z4N8 544 aa7.32□□□□□ -1.24
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GABRE-210ENST00000489333 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.32□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 MBD3L1Q8WWY6 194 aa7.32□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 HIST1H2BAQ96A08 127 aa7.32□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 TVP23CQ96ET8 276 aa7.32□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.32□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
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GABRE-210ENST00000489333 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.32□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
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GABRE-210ENST00000489333 FBXO7Q9Y3I1 522 aa7.32□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
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GABRE-210ENST00000489333 A0A096LPE4 126 aa7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 A0A1W2PPZ6 126 aa7.31□□□□□ -1.24
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GABRE-210ENST00000489333 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa7.31□□□□□ -1.24
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GABRE-210ENST00000489333 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 RNF224P0DH78 156 aa7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 PGA5P0DJD9 388 aa7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 DYNLT3P51808 116 aa7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 PPP1CBP62140 327 aa7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 Q6P435 159 aa7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 FDCSPQ8NFU4 85 aa7.31□□□□□ -1.24
GABRE-210ENST00000489333 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.31□□□□□ -1.24
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