RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 ERVS71-1P61550 626 aa3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 LSM6P62312 80 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 FMODQ06828 376 aa3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 RSU1Q15404 277 aa3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 BRMS1LQ5PSV4 323 aa3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 SYPL2Q5VXT5 272 aa3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 GLYATQ6IB77 296 aa3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 FAM131AQ6UXB0 335 aa3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 CLEC20AQ6ZU45 233 aa3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 LINC01551Q86U37 167 aa3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 SLC35G3Q8N808 338 aa3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 ZDHHC22Q8N966 263 aa3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 OR1M1Q8NGA1 313 aa3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 OR9A2Q8NGT5 310 aa3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 FAM57AQ8TBR7 257 aa3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 VSIRQ9H7M9 311 aa3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 TIAM1Q13009 1591 aa3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 MYO5CQ9NQX4 1742 aa3.15□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PP64 1363 aa3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 TCF21O43680 179 aa3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 EPPINO95925 133 aa3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 HLA-DQB1P01920 261 aa3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 IL3P08700 152 aa3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 SEC11BP0C7V7 166 aa3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 GABRA1P14867 456 aa3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 UCHL3P15374 230 aa3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 MIPP30301 263 aa3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 DAD1P61803 113 aa3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 HIST3H3Q16695 136 aa3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 FAM222AQ5U5X8 452 aa3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa3.14□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 OR2V1Q8NHB1 315 aa3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 ASB17Q8WXJ9 295 aa3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 PRSS27Q9BQR3 290 aa3.14□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 CHCHD7Q9BUK0 85 aa3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 PECRQ9BY49 303 aa3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 AGLP35573 1532 aa3.14□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa3.13□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 BET1O15155 118 aa3.13□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 IGLV3-25P01717 112 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 CRYBA1P05813 215 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 CXCL3P19876 107 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 S100A2P29034 98 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 MAGEA12P43365 314 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 SYCNQ0VAF6 134 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 BTN1A1Q13410 526 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 BATFQ16520 125 aa3.13□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 C15orf56Q8N910 161 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 C12orf29Q8N999 325 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 TMEM35BQ8NCS4 154 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 OR2Z1Q8NG97 314 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 OR52N1Q8NH53 320 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 NEK7Q8TDX7 302 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
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CCL20-204ENST00000489160 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 OR51I1Q9H343 314 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 LHX9Q9NQ69 397 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 UBQLN4Q9NRR5 601 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 CA10Q9NS85 328 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa3.13□□□□□ -1.91
CCL20-204ENST00000489160 VPS29Q9UBQ0 182 aa3.13□□□□□ -1.91
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