RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487485.1

TOP3B-216, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 3

Gene TOP3B, Length 725 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-216ENST00000487485 HSPA12AO43301 675 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 YPEL1O60688 119 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 TPPPO94811 219 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 FBP1P09467 338 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 ZBTB25P24278 435 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 HTR1DP28221 377 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 S100A5P33763 92 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 CEACAM6P40199 344 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 CBX5P45973 191 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 ZNF134P52741 427 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 GNMTQ14749 295 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 HLA-DRB5Q30154 266 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 Q3ZCU0 254 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 IGSF11Q5DX21 431 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 STEAP3Q658P3 488 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 TREML4Q6UXN2 200 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 HOGA1Q86XE5 327 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 C15orf40Q8WUR7 153 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 C17orf50Q8WW18 174 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 MALSU1Q96EH3 234 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 AJUBAQ96IF1 538 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 YPEL2Q96QA6 119 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 ABHD1Q96SE0 405 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 MMP28Q9H239 520 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 ZNRD1Q9P1U0 126 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 SLC23A1Q9UHI7 598 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.65□□□□□ -1.02
TOP3B-216ENST00000487485 FABP12A6NFH5 140 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 LEUTXA8MZ59 168 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 SULT1C2O00338 296 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 BET1O15155 118 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 RGS11O94810 467 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 FCER2P06734 321 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 PAX6P26367 422 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 IL18Q14116 193 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 HERPUD1Q15011 391 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 SSX2Q16385 188 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 CT45A1Q5HYN5 189 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 LY6G6FQ5SQ64 297 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 Q6YL49 198 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 LINC00311Q8N616 119 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 ZNF439Q8NDP4 499 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 BEST4Q8NFU0 473 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 OR10X1Q8NGY0 326 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 OR10J5Q8NHC4 309 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 CT45A3Q8NHU0 189 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 GPX8Q8TED1 209 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 CREB3L1Q96BA8 519 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 MEGF9Q9H1U4 602 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 PRDM13Q9H4Q3 707 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 SCPEP1Q9HB40 452 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 IFT46Q9NQC8 304 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 OR1A1Q9P1Q5 309 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 DPM3Q9P2X0 92 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.64□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 LY6LH3BQJ8 138 aa8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 SLC31A2O15432 143 aa8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 DIRAS3O95661 229 aa8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 LPLP06858 475 aa8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 CTXN2P0C2S0 81 aa8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 CEACAM3P40198 252 aa8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 UBA52P62987 128 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 FOXL1Q12952 345 aa8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 CNPY1Q3B7I2 92 aa8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 PYHIN1Q6K0P9 492 aa8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 OR2AK2Q8NG84 335 aa8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 FCAMRQ8WWV6 532 aa8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 SNAPC3Q92966 411 aa8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 TOLLIPQ9H0E2 274 aa8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 RABL2BQ9UNT1 228 aa8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 GABARAPH6UMI1 98 aa8.62□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 ITGB1BP1O14713 200 aa8.62□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 RBBP9O75884 186 aa8.62□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 HKR1P10072 659 aa8.62□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 NAT1P18440 290 aa8.62□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 IL3RAP26951 378 aa8.62□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 ARPC4P59998 168 aa8.62□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 BAMBIQ13145 260 aa8.62□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 PLA1AQ53H76 456 aa8.62□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa8.62□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 FAM131AQ6UXB0 335 aa8.62□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 LYG1Q8N1E2 194 aa8.62□□□□□ -1.03
TOP3B-216ENST00000487485 OR5AP2Q8NGF4 316 aa8.62□□□□□ -1.03
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