RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 DYRK2Q92630 601 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 RDH5Q92781 318 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CEP19Q96LK0 163 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 LURAP1Q96LR2 239 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CCL13Q99616 98 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 NRIP2Q9BQI9 281 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 UQCC2Q9BRT2 126 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 LPAR5Q9H1C0 372 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 TLNRD1Q9H1K6 362 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 HMG20AQ9NP66 347 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 DUX4Q9UBX2 424 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ST3GAL6Q9Y274 331 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 PPIAL4AQ9Y536 164 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 POLQO75417 2590 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 HECTD1Q9ULT8 2610 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV18A0A075B6X5 111 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV39A0A0B4J263 110 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 MEIS3P1A6NDR6 274 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 OOEPA6NGQ2 149 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC30A6NM36 301 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 OR2AT4A6NND4 320 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 SRRM5B3KS81 715 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 DEGS1O15121 323 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 RP2O75695 350 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 OR2H2O95918 312 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 PSG2P11465 335 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 GTF2F2P13984 249 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 MYOD1P15172 320 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF44P15621 663 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 GNB3P16520 340 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CDK2P24941 298 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 PRDX2P32119 198 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 PITPNBP48739 271 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM50BP56557 158 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 FGF12P61328 243 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ERVK11-1P61568 191 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2V1Q13404 147 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF674Q2M3X9 581 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 VWC2Q2TAL6 325 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 Q6P435 159 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CNIH2Q6PI25 160 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 C6orf201Q7Z4U5 140 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CROCCP3Q8IVE0 287 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 SAXO1Q8IYX7 474 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 FAM216BQ8N7L0 139 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 TPRX1Q8N7U7 411 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ZNRF1Q8ND25 227 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 OR4M1Q8NGD0 313 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 OR10Z1Q8NGY1 313 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 KCNG3Q8TAE7 436 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 AP3S1Q92572 193 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 DIRAS2Q96HU8 199 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM246Q9BRR3 403 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 FAAP24Q9BTP7 215 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM59Q9BXS4 323 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CHST6Q9GZX3 395 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CST11Q9H112 138 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM165Q9HC07 324 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 RHBDL2Q9NX52 303 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ABRACLQ9P1F3 81 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 RAB22AQ9UL26 194 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 SPATA2Q9UM82 520 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 OR2W1Q9Y3N9 320 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 WIPI2Q9Y4P8 454 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 PEX16Q9Y5Y5 336 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 NPTNQ9Y639 398 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 APCP25054 2843 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ARID1AO14497 2285 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 TANC2Q9HCD6 1990 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 PTPN13Q12923 2485 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 ABCA12Q86UK0 2595 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 TRAV24A0A0B4J272 114 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0G2JMP0 313 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0X1KG70 313 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 MEIOCA2RUB1 952 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 A4D1N5 150 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM235A6NFC5 223 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 CLDN25C9JDP6 229 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 FAM90A26D6RGX4 464 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-211ENST00000484135 LGALS8O00214 317 aa3.86□□□□□ -1.79
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