RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461849.1

RBM39-222, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 861 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-222	ENST00000461849	IL18	Q14116	193 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	KIR2DS1	Q14954	304 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	HMGN3	Q15651	99 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	PLA1A	Q53H76	456 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	C11orf88	Q6PI97	169 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	CCDC107	Q8WV48	283 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	MALSU1	Q96EH3	234 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	AJUBA	Q96IF1	538 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	ABHD1	Q96SE0	405 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	TRDC	B7Z8K6	153 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	GABARAP	H6UMI1	98 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	F2RL2	O00254	374 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	SPINT2	O43291	252 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	PTHLH	P12272	177 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	SSTR5	P35346	364 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	HLA-DRB3	P79483	266 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	ZNF45	Q02386	682 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	SSX2	Q16385	188 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	ZNF626	Q68DY1	528 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	OR52W1	Q6IF63	320 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	HOGA1	Q86XE5	327 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	SETD6	Q8TBK2	473 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	ARL11	Q969Q4	196 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849		A0A087X0M5	115 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849		A0A1B0GX30	115 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	VGLL3	A8MV65	326 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	ODF3B	A8MYP8	253 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	HBZ	P02008	142 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	NAT1	P18440	290 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	ACTB	P60709	375 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	HTD2	P86397	168 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	DEFA6	Q01524	100 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	S100Z	Q8WXG8	99 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	GALM	Q96C23	342 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM39-222	ENST00000461849	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	FABP7	O15540	132 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	PEX14	O75381	377 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	RCVRN	P35243	200 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	RAB13	P51153	203 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	HERPUD1	Q15011	391 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	ZNF79	Q15937	498 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849		Q3ZCU0	254 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	STEAP3	Q658P3	488 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	MFSD4A	Q8N468	514 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	BEST4	Q8NFU0	473 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	OR52I2	Q8NH67	350 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	KIRREL1	Q96J84	757 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	IFT46	Q9NQC8	304 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	JPT1	Q9UK76	154 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	TCF19	Q9Y242	345 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	KCNAB3	O43448	404 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	CSF1	P09603	554 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	CTXN2	P0C2S0	81 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	CD34	P28906	385 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	LOXL3	P58215	753 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	DGCR2	P98153	550 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	MADCAM1	Q13477	382 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM39-222	ENST00000461849	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		11.13	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128 ms