RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453333.1

SEMA3E-204, Transcript of semaphorin 3E, humanhuman

TSL 3

Gene SEMA3E, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3E-204ENST00000453333 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 HSD17B6O14756 317 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 FGF16O43320 207 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 RBBP9O75884 186 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 MMP23AO75900 390 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 OR2F2O95006 317 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 GNB3P16520 340 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 RAB13P51153 203 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 EFNB2P52799 333 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 ARPC4P59998 168 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 VBP1P61758 197 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 MSMO1Q15800 293 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 TMEM69Q5SWH9 247 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 CNIH2Q6PI25 160 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 IZUMO1Q8IYV9 350 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 PRR18Q8N4B5 295 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 SAMD12Q8N8I0 201 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 ZNF439Q8NDP4 499 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 SETD6Q8TBK2 473 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 IL1F10Q8WWZ1 152 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 RNF5Q99942 180 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 CHIAQ9BZP6 476 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 ZNF221Q9UK13 617 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 A3GALT2U3KPV4 340 aa7.57□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 A0A1W2PRD5 423 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 A0A1W2PRF3 423 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 A0A1W2PRM7 423 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 A6NDX4 124 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 OR5H14A6NHG9 310 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 ST8SIA5O15466 376 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 CEACAM6P40199 344 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 RAG2P55895 527 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 TAS2R46P59540 309 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 NCS1P62166 190 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 LSM3P62310 102 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 CBX3Q13185 183 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 EBI3Q14213 229 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 OR1L1Q8NH94 360 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 OR2T6Q8NHC8 308 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 SLC25A38Q96DW6 304 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 GINS4Q9BRT9 223 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 AUNIPQ9H7T9 357 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.56□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 A0A075B6Q4 140 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 TRAV18A0A075B6X5 111 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 MOSP00540 346 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 CLEC2LP0C7M8 214 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 RRASP10301 218 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 TBPP20226 339 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 PRSS3P35030 304 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 GDNFP39905 211 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 GNG10P50151 68 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 ACTBP60709 375 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 LTC4SQ16873 150 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 ACTBL2Q562R1 376 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 CT45A1Q5HYN5 189 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 HOGA1Q86XE5 327 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 Q8N2B8 174 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 C3orf56Q8N813 242 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 CT45A3Q8NHU0 189 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 AIFM2Q9BRQ8 373 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 GON7Q9BXV9 100 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 KCNK15Q9H427 330 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 RNF167Q9H6Y7 350 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 IFT46Q9NQC8 304 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa7.54□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 A0A0B4J203 849 aa7.54□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.54□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 A0A1W2PPI3 338 aa7.54□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 TMEM235A6NFC5 223 aa7.54□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 TIMM23O14925 209 aa7.54□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SEMA3E-204ENST00000453333 GPR12P47775 334 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms