RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 IL17FQ96PD4 163 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD10Q9NXR5 420 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 PSENENQ9NZ42 101 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 FZR1Q9UM11 496 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 PREX2Q70Z35 1606 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 F2RL2O00254 374 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 NPFFO15130 113 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 C1QTNF9P0C862 333 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 RUNX1Q01196 453 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 IHHQ14623 411 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM155Q4W5P6 130 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 TNS3Q68CZ2 1445 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM211Q6ICI0 200 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 VGLL1Q99990 258 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 NPVFQ9HCQ7 196 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0U1RQV1 116 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 RRHO14718 337 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 ORM2P19652 201 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 RND2P52198 227 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 ACSM6Q6P461 480 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 RNF181Q9P0P0 153 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 MSGN1A6NI15 193 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 PITX3O75364 302 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 MOSP00540 346 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 FAM159AQ6UWV7 190 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 DOK3Q7L591 496 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 C10orf111Q8N326 155 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 ARPC1AQ92747 370 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 PRELID3AQ96N28 172 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SCNM1Q9BWG6 230 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 VSIG4Q9Y279 399 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 K7EN84 100 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 TNFSF14O43557 240 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 GPX1P07203 203 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 TDRG1Q3Y452 100 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 FAM214BQ7L5A3 538 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 C3orf56Q8N813 242 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 RPEQ96AT9 228 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 AP5S1Q9NUS5 200 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 IL36GQ9NZH8 169 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 ATRNO75882 1429 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SYNGR3O43761 229 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 LYZL6O75951 148 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 NKX2-2O95096 273 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF688P0C7X2 276 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SERF2P84101 59 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 LYSMD4Q5XG99 296 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SLC23A3Q6PIS1 610 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 ZADH2Q8N4Q0 377 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SH3BGRL3Q9H299 93 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 IL17CQ9P0M4 197 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 UGGT1Q9NYU2 1555 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SPAG17Q6Q759 2223 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PRF3 423 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PRM7 423 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 CD3EP07766 207 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SRYQ05066 204 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 UBALD2Q8IYN6 164 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 OR13A1Q8NGR1 328 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 C10orf35Q96D05 121 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SUSD3Q96L08 255 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 RASL11BQ9BPW5 248 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 FBXL15Q9H469 300 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 BTG4Q9NY30 223 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 EPDR1Q9UM22 224 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 MYO5BQ9ULV0 1848 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 CEP170Q5SW79 1584 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GW64 132 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 FAM181BA6NEQ2 426 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF732B4DXR9 585 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 P01737 135 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 PTGDSP41222 190 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 SP6Q3SY56 376 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 POM121L1PQ3SYA9 428 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 LCN12Q6JVE5 192 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 FAM57BQ71RH2 274 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 MMD2Q8IY49 270 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 OR2L13Q8N349 312 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 RDH5Q92781 318 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-209ENST00000442510 PELI1Q96FA3 418 aa4.84□□□□□ -1.63
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