RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 SAXO1Q8IYX7 474 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 CA13Q8N1Q1 262 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 D2HGDHQ8N465 521 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 BTF3L4Q96K17 158 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP5SQ99766 215 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 APOOQ9BUR5 198 aa7.21□□□□□ -1.26
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RABGEF1-203ENST00000439720 PARLQ9H300 379 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF737O75373 536 aa7.21□□□□□ -1.26
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RABGEF1-203ENST00000439720 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZS52 159 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC38A9Q8NBW4 561 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 OR10G6Q8NH81 332 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 C16orf52Q8NHV5 167 aa7.21□□□□□ -1.26
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RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.21□□□□□ -1.26
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RABGEF1-203ENST00000439720 RNF114Q9Y508 228 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PRX2 142 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 C17orf105B2RV13 164 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 H0YGG7 62 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 SERF1AO75920 110 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 SEMA4FO95754 770 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 CER1O95813 267 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 IFNA5P01569 189 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 GYPAP02724 150 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 DTYMKP23919 212 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 LYSMD4Q5XG99 296 aa7.2□□□□□ -1.26
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RABGEF1-203ENST00000439720 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.2□□□□□ -1.26
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RABGEF1-203ENST00000439720 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 SERGEFQ9UGK8 458 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 SZT2Q5T011 3432 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PPV4 95 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.2□□□□□ -1.26
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RABGEF1-203ENST00000439720 CHST1O43916 411 aa7.2□□□□□ -1.26
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RABGEF1-203ENST00000439720 HERV-K104P63124 156 aa7.2□□□□□ -1.26
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RABGEF1-203ENST00000439720 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 WDFY1Q8IWB7 410 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 UEVLDQ8IX04 471 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 GPHA2Q96T91 129 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 PLK3Q9H4B4 646 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.2□□□□□ -1.26
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RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PR80 420 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 NPIPA2E9PIF3 369 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 PAFAH1B2P68402 229 aa7.19□□□□□ -1.26
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RABGEF1-203ENST00000439720 MSMO1Q15800 293 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGEF1-203ENST00000439720 FIGLAQ6QHK4 219 aa7.19□□□□□ -1.26
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